Nella stagione 2004-2005 la Pro Patria allenata da Patrizio Sala disputa il girone A del campionato di Serie C1, Ottiene 45 punti con il decimo posto, nel campionato che ha promosso due matricole, la Cremonese direttamente ed il Mantova che ha vinto i Play-off. Nel girone di andata la squadra bustocca totalizza 30 punti ed è quinta in classifica; nel girone di ritorno dimezza il bottino, raccogliendo 15 punti, che la portano comunque al 10º posto finale, al riparo da ogni pericolo. Miglior marcatore stagionale dei tigrotti è Gianluca Temelin con 16 reti, 12 delle quali in campionato.
Grazie alla finale ottenuta l'anno prima in Coppa Italia di Serie C, la Pro Patria affronta la Coppa Italia maggiore, dove viene eliminata nel secondo girone di qualificazione, con Atalanta, AlbinoLeffe e Vicenza. In Coppa Italia di Serie C viene eliminata subito ad opera del Cittadella nel doppio confronto dei sedicesimi di finale.
Lo sponsor tecnico per la stagione 2004-2005 è Lotto; sulla maglia, per il terzo anno, vi è come sponsor "Ge.S.A." (Gestione Servizi Aziendali).
La prima maglia resta la classica biancoblu, con dei leggeri profili rossi; la seconda maglia è totalmente nera.
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