Nella stagione 2001-2002 la Pro Patria disputa il girone A del campionato di Serie C2, raccoglie 53 punti che valgono il quarto posto. Dopo un girone di andata iniziato con tre pareggi e chiuso con 33 punti al secondo posto dietro l'Alessandria, la Pro Patria all'inizio del girone di ritorno perde punti, e alla 22ª giornata, a seguito della sconfitta (3-1) subita a Meda, avviene il cambio in panchina tra Gianfranco Motta e Carlo Muraro, che vince ad Alessandria e risale al terzo posto. La stagione regolare si chiude con la promozione diretta dell'Alessandria e con i tigrotti che si prendono il 4º posto, che vale gli spareggi promozione. Nei play-off incontra prima il Novara in semifinale, pareggiando l'andata (1-1) a Busto Arsizio e vincendo a Novara (1-2) grazie a una doppietta di Stefano Dall'Acqua; poi nelle finali trova la Sangiovannese, che batte (1-0) sia in Toscana che nel ritorno allo Speroni, un'impresa dei bustocchi, che significa il ritorno in Serie C1 della Pro Patria, a distanza di venti anni. Miglior marcatore stagionale Stefano Dall'Acqua autore di 15 reti, 2 in Coppa Italia e 13 in campionato. Nella Coppa Italia di Serie C ad agosto la Pro Patria disputa il girone A di qualificazione, che ha promosso ai sedicesimi la Biellese.
Lo sponsor tecnico per la stagione 2001-2002 è Lotto; sulla maglia vi è come sponsor principale "La Fenice Assicurazioni", mentre come sponsor secondario "Faciba Planet".
La prima maglia resta la classica biancoblu; la seconda maglia è blu scura, con una banda biancoblu sul petto.
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