Nella stagione a cavallo del secolo, come è ormai consuetudine, quando la SPAL non vince in Serie C1 si cambia tecnico. Ne fa le spese l'allenatore Gianni De Biasi, che viene sostituito da Giancarlo D'Astoli.
In campionato i biancazzurri arrivano in testa alla classifica tra ottobre e metà novembre, ma qualche problema emerge verso l'inverno, come spesso accade in questi anni agli estensi. La beffarda sconfitta di Lucca, nell'ultima di andata, rappresenta l'inizio di un dissidio tra l'allenatore e il direttore sportivo Roberto Ranzani, che porterà quest'ultimo a caldeggiare un cambio in panchina. Il presidente Giovanni Donigaglia decide però di continuare con D'Astoli, sfiduciando in pratica il diesse spallino. Si conclude così il campionato in ottava posizione, fuori anche dai play-off, mentre si annuncia l'ennesimo ribaltone.
Nella Coppa Italia nazionale la Spal è inserita nel gruppo 8 con Ravenna, Vicenza ed Alzano, il girone è stato vinto dal Ravenna che accede al secondo turno. Nella Coppa Italia di Serie C gli estensi entrano in scena nei sedicesimi, ma sono subito eliminati, nel doppio confronto con il Padova.
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