Nella stagione 1987-1988 il Pavia dopo la promozione, disputa il girone A del campionato di Serie C1, con 21 punti si piazza penultimo e retrocede ancora in Serie C2. Mentre le favorite Ancona e Monza hanno conquistato a braccetto la promozione in Serie B, per il Pavia è stato un campionato diviso in due distinte fasi, un buon girone di andata concluso con 17 punti a metà classifica ed un pessimo girone di ritorno, con soli 10 punti portati a casa, con serie negativa di otto sconfitte consecutive, che a quattro giornate dal termine portano all'esonero del tecnico Gianni Bui ed all'arrivo di Gian Piero Ghio. Con lui prima arrivano due sconfitte e poi le due vittorie finali, che fanno sognare la salvezza, ma si abbatte sul Pavia pesantissima la mannaia di 5 punti decisivi di penalizzazione, per una combine nel pre partita di Fano, penultima di campionato, con una inibizione di tre anni per il presidente Claudio Achilli, penalizzazione e squalifica confermate il 20 agosto dalla C.A.F., dopo il ricorso. Una pagina nera che non si cancellerà negli anni a venire.
Nella Coppa Italia di Serie C la squadra pavese vince il girone C di qualificazione, superando Derthona, Entella e Vogherese, prima del campionato, in questo girone, per questa stagione la vittoria vale 3 punti, il pareggio porta invece ai calci di rigore, chi vince intasca 2 punti, chi li perde 1 punto. La squadra pavese esperimenta questo nuovo regolamento dopo i pareggi con Derthona e Vogherese, due (1-1). Poi nei sedicesimi di finale il Pavia viene eliminato nel doppio confronto dal Monza, dopo i tempi supplementari ed i calci di rigore.
calcio
Pavia
Gianni Bui dalla 31ª giornata 
Centese
Vis Pesaro
Lanerossi Vicenza
SPAL
Derthona
Trento
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Livorno
Fano
Vogherese