Il campionato italiano di calcio di Eccellenza regionale 2006-2007 è stato il sedicesimo organizzato in Italia. Rappresenta il sesto livello del calcio italiano.
Questi sono i gironi organizzati dal Comitato Regionale Marche.
Il torneo trovò stabilità con 18 squadre al via. Dalla Serie D proveniva l'Urbino, dalla Promozione erano salite Castelfrettese e Recanatese, dopo 2 stagioni di assenza, il Montegranaro che tornava dopo 3 stagioni, e il Piano San Lazzaro al debutto nel massimo torneo regionale.
Nonostante gli ingenti investimenti dello stilista Dirk Bikkembergs, fu la Recanatese a stazionare in vetta per tutto il torneo. I leopardiani colsero la seconda promozione consecutiva e condannarono il Fossombrone agli spareggi. I tartufai si imposero in quelli regionali ma non in quelli nazionali.
In fondo alla graduatoria si registrò la retrocessione di Real Vallesina e Falco Acqualagna, da allora mai più tornate in Eccellenza. Altra squadra che non ritrovò più l'Eccellenza fu il Caldarola che perse i playout. Si salvò invece il Porto Sant'Elpidio che beffò il Montegranaro, condannandolo a un immediato ritorno in Promozione.
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Montegiorgio
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