Nel 1934 la squadra in crisi viene sciolta. L'attività della società riprende nel 1939 e l'anno successivo vince i campionati provinciali.
Vince il campionato di Prima Divisione 1942-1943 e viene promossa in Serie C, campionato poi sospeso a causa della guerra. La stagione successiva, fermi i campionati ufficiali, viene indetto il torneo di guerra 1943-1944 gestito per le qualificazioni venete dal Direttorio III Zona, nel quale la Sambo è ammessa quale squadra di Serie C.
I campionati ufficiali riprendono nel 1945 e la Sambonifacese conclude al 3º posto.
Nel 1947 sfiora la promozione in Serie B, ma perde l'ultima partita decisiva per la promozione contro il Bolzano. L'anno successivo al grande sogno termina il campionato al 14º posto e lascia la Serie C, essendo retrocessa, precipitando nelle categorie regionali.
Solo nel 1995 la squadra conquista un'importante promozione nel campionato d'Eccellenza Veneto nel quale milita con successo fino al 2003, stagione che la Sambonifacese conclude al 1º posto conquistando la Serie D. Qui si dimostra sempre competitiva, occupando costantemente le prime posizioni in classifica, disputando anche i play-off più volte.
Nel 2007-2008 la squadra, che conclude la "regular season" al 3º posto, vince i play-off di girone sconfiggendo in finale il Chioggia Sottomarina (0-1). La Sambo approda così ai play-off nazionali di Serie D fino a raggiungere la finale nazionale, dove sconfigge la Colligiana per 3-0 sul campo neutro di Carpi, ottenendo così (grazie alla prima posizione nella graduatoria dei ripescaggi) la promozione in Lega Pro Seconda Divisione, nella quale militerà dal campionato 2008-2009.
Nella stagione 2009-2010 la squadra partecipa per la seconda stagione consecutiva alla Seconda Divisione di Lega Pro e per la terza volta consecutiva alla Coppa Italia di Lega Pro. In campionato la Sambonifacese si rende protagonista di un ottimo girone d'andata che la posiziona stabilmente nei primi posti della classifica, ma sul finale di stagione, a seguito di un girone di ritorno nel quale colleziona pochissimi punti, si ritrova coinvolta nella lotta per non retrocedere ma riesce a concludere la corsa all'11º posto, salvandosi dalla roulette dei play-out per due punti. In Coppa Italia di Lega Pro supera la fase eliminatoria a gironi ma viene eliminata per 2-1 dall'Hellas Verona nel primo turno della Fase 1 ad eliminazione diretta. Alla fine della stagione 2011-2012 retrocede in Serie D.
Segue una caduta verticale con retrocessioni per ogni anno fino a giungere nel 2017 alla Terza Categoria, ultimo gradino della piramide calcistica italiana.
Nel giugno 2020 la società si fonde con l'altro club cittadino il Pro San Bonifacio, che milita nella Prima Categoria ed assume la nuova denominazione Associazione Sportiva Dilettante Pro Sambonifacese 1921 [2]
1927 - Si affilia alla F.I.G.C. e partecipa ai campionati regionali di Terza Divisione organizzati dal Direttorio Regionale Veneto.
1927-28 - 5º nel girone A della Terza Divisione Veneta.
1928-29 - 5º nel girone A della Terza Divisione Veneta.
1929-30 - 4º nel girone A della Terza Divisione Veneta.
1930-31 - 2º nel girone A della Terza Divisione Veneta, avendo perso 1-2 a Zevio lo spareggio del 1º marzo 1931 contro il San Giovanni Lupatoto. Vince la Coppa Veneta.
1931-32 - nel girone A della Terza Divisione Veneta, ammessa alle finali e poi promossa in Seconda Divisione Veneta.
1932-33 - 5º nel girone B della Seconda Divisione Veneta.
1933-34 - 6º nel girone B della Seconda Divisione Veneta.
1934-1939 - Attività sospesa, causa ?.
1939 - Si iscrive al campionato di Seconda Categoria della Sezione Propaganda di Verona con la denominazione Gruppo Sportivo Fascista Sambonifacese.
1939-40 - In Seconda Categoria S.P. Veronese. Disputa la 3ª Coppa Veneta indetta dal Direttorio III Zona: supera al primo turno le riserve del Marzotto Valdagno e dopo due turni si deve arrendere.
1941-42 - 1° nella Seconda Categoria S.P. Veronese, è campione Veronese di Seconda Categoria S.P.. Alle finali è battuto al primo turno dal Bassanello (1-0 in casa e 0-2 fuori).
1942 - Riaffiliata alla F.I.G.C. con la nuova denominazione Pol. Sambonifacese.
1942-43 - 2º nel girone A della Prima Divisione Veneta, 2º nel girone finale. Promossa in Serie C. Cambia denominazione in A.C. Sambonifacese.
1943-44 - 6º nel girone B del Campionato Misto Alta Italia gestito dal Direttorio III Zona (Veneto).
1944-45 - Attività sospesa per cause belliche.
1945-46 - 3º nel girone C della Serie C Alta Italia.
1946-47 - 2º nel girone G della Serie C Lega Interregionale Nord.
1947-48 - 14º nel girone G della Serie C Lega Interregionale Nord perdendo lo spareggio con il Montagnana. Retrocessa in Prima Divisione.
1948-49 - 8º nel girone B della Prima Divisione Veneta.
1949-50 - 16º nel girone E della Prima Divisione Veneta. Retrocessa in Seconda Divisione.
1950-51 - 7º nel girone B della Seconda Divisione Veneta.
1951-52 - 6º nel girone I della Seconda Divisione Veneta.
1952-53 - 3º nel girone A della Seconda Divisione Veneta.
1953-54 - 1º nel girone A della Seconda Divisione Veneta. Promossa in Prima Divisione. Perde la semifinale per il titolo col Quinto.
1954-55 - 1º nel girone B della Prima Divisione. Promossa in Promozione.
1955-56 - 2º nel girone A in Promozione Veneto perdendo lo spareggio con la Scaligera.
1971-72 - 16º nel girone A in Promozione Veneto, retrocede in Prima Categoria.
1972 - Rinuncia alla Prima Categoria e si iscrive in Terza Categoria (Comitato Provinciale di Verona).
1972-73 - 2º nel girone D della Terza Categoria Veronese.
1973-74 - 10º nel girone D della Terza Categoria Veronese. Ammessa in Seconda Categoria. Cambia denominazione in A.C. F.E.R. Sambonifacese.
1974-75 - 5º nel girone C in Seconda Categoria Veneto. Ammessa in Prima Categoria a completamento organici.
1975-76 - 7º nel girone A della Prima Categoria Veneta.
1976-77 - 2º nel girone A della Prima Categoria Veneta.
1977-78 - 12º nel girone A della Prima Categoria Veneta, salvo per differenza reti con Juventina Monteforte e Isola Rizza.
1978-79 - 4º nel girone A della Prima Categoria Veneta.
1979-80 - 7º nel girone A della Prima Categoria Veneta.
1980-81 - 10º nel girone A della Prima Categoria Veneta.
1981-82 - 4º nel girone B della Prima Categoria Veneta. Cambia denominazione in A.C. Sambonifacese.
1982-83 - 14º nel girone A della Prima Categoria Veneta, retrocede in Seconda Categoria.
1983-84 - 5º nel girone C in Seconda Categoria Veneto.
1984-85 - 8º nel girone C in Seconda Categoria Veneto.
1985-86 - 3º nel girone C in Seconda Categoria Veneto.
1986-87 - 1º nel girone C in Seconda Categoria Veneto, dopo aver vinto lo spareggio con lo Zevio 6-4 d.c.r.. Promossa in Prima Categoria.
1987-88 - 9º nel girone B della Prima Categoria Veneta.
1988-89 - 3º nel girone B della Prima Categoria Veneta. Cambia denominazione in A.C. Sambonifacese Don Bosco.
1989-90 - 13º nel girone B della Prima Categoria Veneta. Ammessa in Promozione a completamento organici.
1990-91 - 12º nel girone A in Promozione Veneto. Con la creazione dell'Eccellenza la Promozione è declassata a 7º livello della scala dei valori F.I.G.C..
1991-92 - 14º nel girone A in Promozione Veneto, retrocede in Prima Categoria. Riammessa a completamento organici.
2014-15 - 16º nel girone A in Eccellenza Veneto.Retrocessa in Promozione. Decide di iscriversi in Prima Categoria.
2015-16 - 16º nel girone B della Prima Categoria Veneto. Retrocessa in Seconda Categoria.
2016-17 - 14º nel girone C della Seconda Categoria Veneto, perde i play-out contro l'Illasi. Retrocessa in Terza Categoria.
2017-18 - 12º nel girone B della Terza Categoria Veneto, comitato di Verona.Ripescata in Seconda Categoria
2018-19 - 13º nel girone C della Seconda Categoria Veneto.
2019-20 - milita nel girone C della Seconda Categoria Veneto, campionato interrotto prima della sua conclusione. Cambia denominazione in A.S.D. Pro Sambonifacese 1921.
2020-21 - milita nel girone B della Prima Categoria Veneto, campionato interrotto prima della sua conclusione.
2021-22 - 1° nel girone B della Prima Categoria Veneto. Promossa in Promozione
L'A.C. Sambonifacese collabora all'organizzazione del Trofeo città di San Bonifacio, competizione ad invito che si svolge tra le squadre giovanili di alcuni tra i club più prestigiosi in Europa. La competizione è anche conosciuta come Trofeo Primo Maggio oppure come Trofeo Ferroli per ragioni di sponsorizzazione.[3]