Varianti del SARS-CoV-2: differenze tra le versioni

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== Epidemiologia ==
== Epidemiologia ==
L'emergere del SARS-CoV-2 potrebbe essere il risultato di eventi di [[ricombinazione genetica]] tra un coronavirus simile alla SARS del [[pipistrello]] e un coronavirus del [[pangolino]] attraverso la trasmissione tra specie.<ref>{{Cita pubblicazione|titolo="SARS-CoV-2 spillover transmission due to recombination event"|doi=10.1016/j.genrep.2021.101045}}</ref>
Esistono diverse varianti di SARS-CoV-2.<ref name="pango-lineages">{{Cita web|url=https://cov-lineages.org/lineages.html |titolo=Lineage descriptions|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref> La tabella seguente presenta le informazioni e il livello di rischio per le varianti con rischio elevato o possibilmente elevato attuale.<ref name="cdc-variants">{{Cita web |url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html |titolo=SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://cov-lineages.org/global_report.html|titolo=Global Report Investigating Novel Coronavirus Haplotypes|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref><ref name="aci-variants">{{cita web|url=https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants |titolo=Living Evidence - SARS-CoV-2 variants|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>

I primi genomi umani di virus disponibili sono stati raccolti dai pazienti a partire dal dicembre 2019 e i ricercatori [[Cina|cinesi]] hanno confrontato questi primi genomi con ceppi di coronavirus di pipistrello e pangolino per stimare il tipo ancestrale di coronavirus umano; il tipo di genoma ancestrale identificato è stato etichettato con "S", e il suo tipo derivato dominante è stato etichettato con "L" per riflettere i cambiamenti dell'amminoacido mutante. Indipendentemente, i ricercatori occidentali hanno effettuato analisi simili ma hanno etichettato il tipo ancestrale "A" e il tipo derivato "B". Il tipo B è mutato in altri tipi, incluso B.1, che è l'antenato delle principali ''varianti di interesse'' (VOC), etichettate nel 2021 dall'[[Organizzazione mondiale della sanità|OMS]] come Alfa, Beta, Gamma e Delta.<ref>{{Cita pubblicazione|autore=Tang, Xiaolu; Wu, Changcheng; Li, Xiang; Song, Yuhe|titolo="On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2"|anno=2020|mese=marzo|doi=10.1093/nsr/nwaa036}}</ref><ref>{{Cita pubblicazione|autore=Forster, Peter; Forster, Lucy; Renfrew, Colin; Forster, Michael|titolo="Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes"|doi=10.1073/pnas.2004999117}}</ref>

La tabella seguente presenta le informazioni e il livello di rischio per le varianti con rischio elevato o possibilmente elevato attuale.<ref name="cdc-variants">{{Cita web |url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html |titolo=SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://cov-lineages.org/global_report.html|titolo=Global Report Investigating Novel Coronavirus Haplotypes|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref><ref name="aci-variants">{{cita web|url=https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants |titolo=Living Evidence - SARS-CoV-2 variants|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>


Legenda relativa al rischio: {{Legend inline|#faa|Molto alto}} {{Legend inline|#fc8|Alto}} {{Legend inline|#fe8|Medio}} {{Legend inline|#cfc|Basso}} {{Legend inline|#eee|Sconosciuto}}
Legenda relativa al rischio: {{Legend inline|#faa|Molto alto}} {{Legend inline|#fc8|Alto}} {{Legend inline|#fe8|Medio}} {{Legend inline|#cfc|Basso}} {{Legend inline|#eee|Sconosciuto}}
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! colspan="5" |Identificazione
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! rowspan="2" |Mutazioni notevoli
! rowspan="2" |Mutazioni notevoli
! colspan="3" |Cambiamenti clinici
! colspan="3" |Cambiamenti clinici
! colspan="2" |Attività anticorpale neutralizzante
|-
|-
!Luogo d'origine
!Data
!Dichiarata "Variant of Concern"
![[Organizzazione mondiale della sanità|OMS]]<ref name="WHO-variants">{{Cita web|url=https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/|titolo=Classificazione OMS|accesso=1 giugno 2021|lingua=en}}</ref>
![[Organizzazione mondiale della sanità|OMS]]<ref name="WHO-variants">{{Cita web|url=https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/|titolo=Classificazione OMS|accesso=1 giugno 2021|lingua=en}}</ref>
![[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]]<wbr/><ref name="pango-lineages"/>
![[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]]<wbr/><ref name="pango-lineages">{{Cita web|url=https://cov-lineages.org/lineages.html |titolo=Lineage descriptions|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
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![[Nextstrain]]<ref name="cdc-variants"/><ref name="nextstrain">{{Cita web|url=https://nextstrain.org/|titolo=Nextstrain|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
![[Public Health England|PHE]]<ref>Il formato dei nomi è stato aggiornato a marzo 2021, cambiando l'anno da 4 a 2 cifre e il mese da 2 cifre a un'abbreviazione di 3 lettere. Ad esempio, ''VOC 202101/02'' diviene ''VOC21JAN/02''</ref>
![[Public Health England|PHE]]<ref>Il formato dei nomi è stato aggiornato a marzo 2021, cambiando l'anno da 4 a 2 cifre e il mese da 2 cifre a un'abbreviazione di 3 lettere. Ad esempio, ''VOC 202101/02'' diviene ''VOC21JAN/02''</ref>
!Altri nomi
!Altri nomi
!Luogo d'origine
!Data
!Dichiarata "Variant of Concern"
![[Numero di riproduzione di base|Trasmissibilità]]
![[Numero di riproduzione di base|Trasmissibilità]]
![[Ospedale|Ospedalizzazione]]
![[Virulenza]]
![[Antigenicità]]
![[Tasso di letalità]]
!Da infezione naturale
!Dalla [[Vaccino anti COVID-19|vaccinazione]]
|-
|-
|rowspan="2"| Alpha
|{{UK}}
|{{data||2|2020}}<wbr/><ref name="pango-lineages"/>
|{{data||12|2020}}
|Alpha
|[[SARS-CoV-2 VOC-202012/01|B.1.1.7]]
|[[SARS-CoV-2 VOC-202012/01|B.1.1.7]]
|20I/501Y.V1
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|VOC-20DEC-01
| —
|rowspan="2"| —
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|{{data|20|9|2020}}<wbr/><ref name="pango-lineages"/>
|{{data|18|12|2020}}<wbr/><ref>{{Cita web|formato=PDF|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf|titolo=Investigation of novel SARS-COV-2 variant, technical briefing 1|data=21 dicembre 2020|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210615114312/https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf|lingua=en}}</ref>
|N501Y, 69–70del, P681H<wbr/><ref name="tre">{{Cita pubblicazione|nome=Chand ''et al.''|anno=2020|p=6|titolo=Potential impact of spike variant N501Y}}</ref>
|N501Y, 69–70del, P681H<wbr/><ref name="tre">{{Cita pubblicazione|nome=Chand ''et al.''|anno=2020|p=6|titolo=Potential impact of spike variant N501Y}}</ref>
|bgcolor="#fc8"| ≈74% in più<wbr/><ref name="volz">{{Cita pubblicazione|autore=Volz E|autore2=Mishra S|autore3=Chand M|autore4=Barrett JC|data=4 gennaio 2021|titolo=Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England: Insights from linking epidemiological and genetic data |url=http://medrxiv.org/lookup/doi/10.1101/2020.12.30.20249034}}</ref>
|rowspan="2" bgcolor="#faa"| +29% (24–33%)<wbr/><ref name="volz">{{Cita pubblicazione|autore=Volz E|autore2=Mishra S|autore3=Chand M|autore4=Barrett JC|data=4 gennaio 2021|titolo=Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England: Insights from linking epidemiological and genetic data |url=http://medrxiv.org/lookup/doi/10.1101/2020.12.30.20249034}}</ref><ref name="trenta">{{Cita pubblicazione|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8212592|titolo="Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021"|autore=Campbell F & co.|anno=2021|mese=giugno|doi=https://doi.org/10.2807%2F1560-7917.ES.2021.26.24.2100509|PMID=34142653}}</ref>
|rowspan="2" bgcolor="#faa"| +52% (47–57%)
|bgcolor="#fc8"| ≈64% più letale<wbr/><ref>{{cita pubblicazione|autore=Challen R|autore2=Brooks-Pollock E|autore3=Read JM|autore4=Dyson L|autore5=Tsaneva-Atanasova K|autore6=Danon L|titolo=Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study|rivista=BMJ|volume=372|p=579|anno=2021|mese=marzo|PMID=33687922|doi=10.1136/bmj.n579|id=579}}</ref>
|bgcolor="#cfc" |Nessun cambiamento
|rowspan="2" bgcolor="#faa"|+59% (44–74%)
|bgcolor="#cfc"| Riduzione minima<ref name="quindici">{{Cita web|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|titolo="SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions"|data=11 febbraio 2020|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210629194456/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|lingua=en}}</ref>
|bgcolor="#cfc"| Riduzione minima<ref name="quindici"/>
|-
|-
|B.1.1.7 with E484K<ref>{{Cita web|url=https://outbreak.info/situation-reports?pango=B.1.1.7&muts=S%3AE484K|titolo=B.1.1.7 Lineage with S:E484K Report|accesso=2 giugno 2021|lingua=en}}</ref>
|{{NGA}}
|VOC‑21FEB‑02
|{{data||3|2020}}<wbr/><ref name="pango-b-1-1-207">{{Cita web |url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.1.207.html|titolo=Lineage B.1.1.207|data=11 marzo 2021}}</ref>
|{{data|26|1|2021}}<ref>{{Cita web|formato=PDF|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959426/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_5.pdf|titolo=Investigation of novel SARS-CoV-2 variant 202012/01, technical briefing 5|data=2 febbraio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210629153356/https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959426/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_5.pdf|lingua=en}}</ref>
|—
|{{data|5|2|2021}}<ref>{{Cita web|formato=PDF|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/961299/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_6_England-1.pdf|titolo=Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in England, technical briefing 6|data=13 febbraio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210429204501/https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/961299/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_6_England-1.pdf|lingua=en}}</ref>
|
|E484K, 69–70del, N501Y, P681H
|B.1.1.207
|bgcolor="#fc8"| Notevolmente ridotto<ref name="ventitre>{{Cita web|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|titolo="SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions"|data=11 febbraio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210629194456/https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html|lingua=en}}</ref>
|—
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|—
|—
|P681H<wbr/><ref name="tre"/>
|bgcolor="#cfc" |Nessun cambiamento<wbr/><ref name="biotecnika">{{Cita web|autore=Sruthi S|titolo=Notable Variants And Mutation Of SARS-CoV-2 |url=https://www.biotecnika.org/2021/02/variants-mutations-of-sars-cov-2-a-complete-list/|data=10 febbraio 2021|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|bgcolor="#cfc" |Nessun cambiamento<ref name="biotecnika"/>
|bgcolor="#eee" |—
|-
|-
|{{USA}}
|{{data||6|2020|}}<wbr/><ref name="Pango B.1.429 (A)">{{cita web |url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.429.html|titolo=Lineage B.1.429 |sito=cov-lineages.org|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|{{data||3|2021}}
|Epsilon
|B.1.429, B.1.427<wbr/><ref name="aci-variants"/>
|20C/S:452R
|—
|CAL.20C
|I4205V, D1183Y, S13I, W152C, L452R
|bgcolor="#fe8" | ≈20% (18,6%–24,2%) più alto<wbr/><ref name="cdc-variants"/><ref>{{Cita pubblicazione|autore=Deng X|autore2=Garcia-Knight MA|autore3=Khalid MM|autore4=Servellita V|autore5=Wang C|autore6=Morris MK|autore7=Sotomayor-González A|autore8=Glasner DR|autore9=Reyes KR|autore10=Gliwa AS|autore11=Reddy NP|autore12=Sanchez San Martin C|autore13=Federman S|autore14=Cheng J|autore15=Balcerek J|autore16=Taylor J|autore17=Streithorst JA|autore18=Miller S|autore19=Kumar GR|autore20=Sreekumar B|autore21=Chen PY|autore22=Schulze-Gahmen U|autore23=Taha TY|autore24=Hayashi J|autore25=Simoneau CR|autore26=McMahon S|autore28=Lidsky PV|autore29=Xiao Y|autore30=Hemarajata P|autore31=Green NM|autore32=Espinosa A|autore33=Kath C|autore34=Haw M|autore35=Bell J|autore36=Hacker JK|autore37=Hanson C|autore38=Wadford DA|autore39=Anaya C|autore40=Ferguson D|autore41=Lareau LF|autore42=Frankino PA|autore43=Shivram H|autore44=Wyman SK|autore45=Ott M|autore46=Andino R|autore47=Chiu CY|titolo= Trasmission, infectivity, and antibody neutralization of an emerging SARS-CoV-2 variant in California carrying a L452R spike protein mutation|rivista=medRxiv|anno=2021|mese=marzo|PMID=33758899|doi=10.1101/2021.03.07.21252647}}</ref>
|bgcolor="#eee" |''Sotto investigazione''
|bgcolor="#faa" |Riduzione da moderata a grave della neutralizzazione<ref name="CaliNews">{{Cita web|autore=Wa=23 febbraio 2021|titolo=California coronavirus strain may be more infectious - and lethal|url=https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|-
|{{ZAF}}
|{{data||10|2020}}<wbr/><ref name="tre"/>
|{{data||12|2020}}
|Beta
|Beta
|B.1.351
|B.1.351
|20H/501Y.V2
|20H (V2)
|VOC-20DEC-02
|VOC-20DEC-02
|501Y.V2<wbr/><ref name="ECDC1">{{Cita web|titolo=Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update|data=2 febbraio 2021|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|501Y.V2<wbr/><ref name="ECDC1">{{Cita web|titolo=Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update|data=2 febbraio 2021|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|{{ZAF}}
|{{data||5|2020}}<wbr/><ref name="tre"/>
|{{data|14|1|2021}}<wbr/><ref>{{Cita web|url=https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-brief-note-on-sars-cov-2-variants-13-january-2021|titolo=NERVTAG paper: brief note on SARS-CoV-2 variants|data=13 gennaio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210606142724/https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-brief-note-on-sars-cov-2-variants-13-january-2021|lingua=en}}</ref>
|N501Y, K417N, E484K<wbr/><ref name="tre"/>
|N501Y, K417N, E484K<wbr/><ref name="tre"/>
|bgcolor="#fc8" |≈50% (20–113%) più alto<wbr/><ref name="ECDC1"/>
|bgcolor="#faa"|+25% (20–30%)<wbr/><ref name="trenta"/>
|bgcolor="#cfc" |Nessun cambiamento<ref name="biotecnika"/>
|bgcolor="#eee"| Sotto investigazione
|bgcolor="#faa"| Possibilmente aumentato<wbr/><ref name="diciassette">{{Cita web|url=https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants|titolo="Living Evidence – SARS-CoV-2 variants"|data=23 luglio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210416012757/https://aci.health.nsw.gov.au/covid-19/critical-intelligence-unit/sars-cov-2-variants|lingua=en}}</ref><ref name="ventidue">{{Cita web|url=https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---20-july-2021|titolo=Weekly epidemiological update on COVID-19 - 20 July 2021|data=20 luglio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210723212538/https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---20-july-2021|lingua=en}}</ref>
|bgcolor="#faa" |Significativa riduzione della neutralizzazione da parte degli anticorpi<wbr/><ref>{{Cita pubblicazione|autore=Planas D|autore2=Bruel T|autore3=Grzelak L|data=14 aprile 2022|titolo=Sensitivity of infectious SARS-CoV-2 B.1.1.7 and B.1.351 variants to neutralizing antibodies|rivista=Nature Medicine |doi=10.1038/s41591-021-01318-5}}</ref>
|bgcolor="#faa"| Risposta ridotta delle cellule T provocata dal virus D614G<ref name="quindici"/><ref name="ventidue"/>
|-
|bgcolor="#fc8"| Efficacia: ridotta contro la malattia sintomatica, mantenuta contro la malattia grave<ref name="ventidue"/>
|{{IND}}
|{{data||10|2020}}<wbr/><ref>{{Cita web|titolo=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.617.html|accesso=1° maggio 2021|lingua=en}}</ref>
|{{data||4|2021}}
|[[SARS-COV-2 variante Delta|Delta]] (B.1.617.2), Kappa (B.1.617.1)
|B.1.617 <small>(B.1.617.1, B.1.617.2, B.1.617.3)</small>
|20A
|VUI-21APR-01, VOC-21APR-02, VUI-21APR-03
|—
|E484Q, L452R, P681R<ref>{{Cita web|autore=Paul Nuki & Sara Newey|titolo=Arrival of India’s ‘double mutation’ adds to variant woes, but threat posed remains unclear|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/arrival-indias-double-mutation-adds-variant-woes-threat-posed/|data=16 aprile 2021|accesso=1º maggio 2021|lingua=en}}</ref>
|bgcolor="#faa" |≈100% in più <wbr/><ref>{{Cita web|url=https://www.gov.uk/government/publications/sage-89-minutes-coronavirus-covid-19-response-13-may-2021/sage-89-minutes-coronavirus-covid-19-response-13-may-2021|titolo=SAGE 89 minutes: Coronavirus (COVID-19) response, 13 May 2021|data=13 maggio 2021|accesso=2 giugno 2021|lingua=en}}</ref>
|bgcolor="#eee" |''Sotto investigazione''
|bgcolor="#cfc" |Leggera riduzione della neutralizzazione effettiva<ref>{{Cita pubblicazione|titolo= Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees|doi=10.1101/2021.04.23.441101}}</ref>
|-
|{{DNK}}
|{{data||9|2020}}<wbr/><ref>{{Cita web|data=6 novembre 2020|titolo=SARS-CoV-2 mink-associated variant strain - Denmark |url=https://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|—
|
|—
|—
|—
|[[Cluster 5]], ΔFVI-spike<wbr/><ref name="SSI short report">{{Cita web|url=https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2|titolo=SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink, their spread to humans and neutralization data|autore=Lassaunière R, Fonager J, Rasmussen M, Frische A, Strandh C, Rasmussen T, et al.|data=10 novembre 2020|accesso=16 aprile 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20201110135434/https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2|dataarchivio=10 novembre 2020|lingua=en}}</ref>
|Y453F, 69–70deltaHV<wbr/><ref name="SSI short report" />
|bgcolor="#eee" | —
|bgcolor="#eee" | —
|bgcolor="#fc8" |Sensibilità moderatamente ridotta agli anticorpi neutralizzanti<ref name="WHO">{{Cita web |url=https://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/|titolo=SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark|data=6 novembre 2020|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|-
|-
|{{JPN}}<br />{{BRA}}
|{{data||12|2020}}<wbr/>
|{{data||1|2021}}
|Gamma
|Gamma
|[[SARS-CoV-2 lignaggio P.1|P.1]]
|[[SARS-CoV-2 lignaggio P.1|P.1]]
|20H (V2)
|20J/501Y.V3
|VOC-21JAN-02
|VOC-21JAN-02
|B.1.1.28.1<wbr/><ref name="aci-variants"/><ref>{{Cita web|url=https://cov-lineages.org/global_report_P.1.html|titolo=P.1|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|B.1.1.28.1<wbr/><ref name="aci-variants"/><ref>{{Cita web|url=https://cov-lineages.org/global_report_P.1.html|titolo=P.1|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
|{{BRA}}
|{{data||11|2020}}
|{{data|15|1|2021}}<wbr/><ref>{{Cita web|url=https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk|titolo=https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk|data=15 gennaio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210507162335/https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk|lingua=en}}</ref><ref>{{Cita web|url=https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-note-on-variant-p1-27-january-2021|titolo=NERVTAG paper: note on variant P.1|data=27 gennaio 2021|urlarchivio=https://web.archive.org/web/20210606142726/https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-note-on-variant-p1-27-january-2021|lingua=en}}</ref>
|N501Y, E484K, K417T<wbr/><ref>{{cita web|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html |titolo=Emerging SARS-CoV-2 Variants |data=28 gennaio 2021 |sito=cdc.org |editore=[[Centers for Disease Control and Prevention]] |accesso=4 gennaio 2021}}</ref>
|N501Y, E484K, K417T<wbr/><ref>{{cita web|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html |titolo=Emerging SARS-CoV-2 Variants |data=28 gennaio 2021 |sito=cdc.org |editore=[[Centers for Disease Control and Prevention]] |accesso=4 gennaio 2021}}</ref>
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|bgcolor="#faa" |≈152% (127 -178% ) in più <wbr/><ref>{{Cita pubblicazione|autore=Coutinho RM|autore2=Marquitti FM|autore3=Ferreira LS|autore4=Borges ME|autore5=da Silva RL|autore6=Canton O|data=23 marzo 2021|titolo=Model-based estimation of transmissibility and reinfection of SARS-CoV-2 P.1 variant |url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v2|doi=10.1101/2021.03.03.21252706|p=9|lingua=en}}</ref>
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|bgcolor="#fe8" |≈45% più letale<ref>{{cita pubblicazione|autore=Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, Claro IM, Candido DD, Mishra S, Crispim MA, Sales FC, Hawryluk I, McCrone JT, Hulswit RJ, Franco LA, Ramundo MS, de Jesus JG, Andrade PS, Coletti TM, Ferreira GM, Silva CA, Manuli ER, Pereira RH, Peixoto PS, Kraemer MU, Gaburo N, Camilo CD, Hoeltgebaum H, Souza WM, Rocha EC, de Souza LM, de Pinho MC, Araujo LJ, Malta FS, de Lima AB, Silva JD, Zauli DA, Ferreira AC, Schnekenberg RP, Laydon DJ, Walker PG, Schlüter HM, Dos Santos AL, Vidal MS, Del Caro VS, Filho RM, Dos Santos HM, Aguiar RS, Modena JL, Nelson B, Hay JA, Monod M, Miscouridou X, Coupland H, Sonabend R, Vollmer M, Gandy A, Suchard MA, Bowden TA, Pond SL, Wu CH, Ratmann O, Ferguson NM, Dye C, Loman NJ, Lemey P, Rambaut A, Fraiji NA, Carvalho MD, Pybus OG, Flaxman S, Bhatt S, Sabino EC |titolo=Genomics and epidemiology of a novel SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil |rivista=Science |data=aprile 2021 | pmid = 33853970 |doi=10.1126/science.abh2644 |citazione=Within this plausible region of parameter space, P.1 can be between 1.7–2.4 (50% BCI, 2.0 median, with a 99% posterior probability of being >1) times more transmissible than local non-P1 lineages, and can evade 21–46% (50% BCI, 32% median, with a 95% posterior probability of being able to evade at least 10%) of protective immunity elicited by previous infection with non-P.1 lineages, corresponding to 54–79% (50% BCI, 68% median) cross-immunity}}</ref>
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|[[SARS-COV-2 variante Delta|Delta]]
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|{{data||12|2020}}<wbr/><ref>{{Cita web|url=https://www.bbc.com/news/health-56082573|titolo="Another new coronavirus variant seen in the UK"|autore=Michelle Roberts|data=16 febbraio 2021|accesso=16 aprile 2021|lingua=en}}</ref>
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|N501Y, 69–70del, P681H, E484K
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|}


Versione delle 10:23, 11 nov 2021

Voce principale: SARS-CoV-2.
Le informazioni riportate non sono consigli medici e potrebbero non essere accurate. I contenuti hanno solo fine illustrativo e non sostituiscono il parere medico: leggi le avvertenze.
Mutazioni positive, negative e neutre durante l'evoluzione dei coronavirus come SARS-CoV-2

La diffusione del SARS-CoV-2 in tutto il globo, ha portato con il passare del tempo alla comparsa di mutazioni e conseguentemente di varianti della sequenza WIV04/2019, ovvero di quella che è nota come la sequenza zero/originale che ha sviluppato la forma originaria della COVID-19.[1]

Epidemiologia

L'emergere del SARS-CoV-2 potrebbe essere il risultato di eventi di ricombinazione genetica tra un coronavirus simile alla SARS del pipistrello e un coronavirus del pangolino attraverso la trasmissione tra specie.[2]

I primi genomi umani di virus disponibili sono stati raccolti dai pazienti a partire dal dicembre 2019 e i ricercatori cinesi hanno confrontato questi primi genomi con ceppi di coronavirus di pipistrello e pangolino per stimare il tipo ancestrale di coronavirus umano; il tipo di genoma ancestrale identificato è stato etichettato con "S", e il suo tipo derivato dominante è stato etichettato con "L" per riflettere i cambiamenti dell'amminoacido mutante. Indipendentemente, i ricercatori occidentali hanno effettuato analisi simili ma hanno etichettato il tipo ancestrale "A" e il tipo derivato "B". Il tipo B è mutato in altri tipi, incluso B.1, che è l'antenato delle principali varianti di interesse (VOC), etichettate nel 2021 dall'OMS come Alfa, Beta, Gamma e Delta.[3][4]

La tabella seguente presenta le informazioni e il livello di rischio per le varianti con rischio elevato o possibilmente elevato attuale.[5][6][7]

Legenda relativa al rischio:   Molto alto   Alto   Medio   Basso   Sconosciuto

Identificazione Primo rilevamento Mutazioni notevoli Cambiamenti clinici Attività anticorpale neutralizzante
OMS[8] Pango[9] Nextstrain[5][10] PHE[11] Altri nomi Luogo d'origine Data Dichiarata "Variant of Concern" Trasmissibilità Ospedalizzazione Tasso di letalità Da infezione naturale Dalla vaccinazione
Alpha B.1.1.7 20I (V1) VOC-20DEC-01 — Bandiera del Regno Unito Regno Unito 20 settembre 2020[9] 18 dicembre 2020[12] N501Y, 69–70del, P681H[13] +29% (24–33%)[14][15] +52% (47–57%) +59% (44–74%) Riduzione minima[16] Riduzione minima[16]
B.1.1.7 with E484K[17] VOC‑21FEB‑02 26 gennaio 2021[18] 5 febbraio 2021[19] E484K, 69–70del, N501Y, P681H Notevolmente ridotto[20] Notevolmente ridotto[20]
Beta B.1.351 20H (V2) VOC-20DEC-02 501Y.V2[21] Bandiera del Sudafrica Sudafrica maggio 2020[13] 14 gennaio 2021[22] N501Y, K417N, E484K[13] +25% (20–30%)[15] Sotto investigazione Possibilmente aumentato[23][24] Risposta ridotta delle cellule T provocata dal virus D614G[16][24] Efficacia: ridotta contro la malattia sintomatica, mantenuta contro la malattia grave[24]
Gamma P.1 20H (V2) VOC-21JAN-02 B.1.1.28.1[7][25] Bandiera del Brasile Brasile novembre 2020 15 gennaio 2021[26][27] N501Y, E484K, K417T[28] +38% (29–48%)[15] Possibilmente aumentato[24] +50% (50%, 20–90%) Ridotto[16] Trattenuto da molti vaccini eccetto Pfizer–BioNTech[23]
Delta B.1.617.2 21A VOC‑21APR‑02 — Bandiera dell'India India ottobre 2020[29] 6 maggio 2021[30] E484Q, L452R, P681R[31] +97% (76–117%)[15] +85% (39–147%)[32] +137% (50–230%) Reinfezioni, con un tasso di occorrenza inferiore rispetto alle infezioni vaccinate[33] Riduzione dell'efficacia per malattie non gravi[24]

Varianti di preoccupazione

Cluster 5

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 Cluster 5.

Rilevata per la prima volta il 2 novembre 2020, dal Statens Serum Institut. È stata resa nota al pubblico con il nome di Cluster 5[34] il 4 novembre seguente dalla prima ministra danese Mette Frederiksen che l'ha definita come una nuova variante di SARS-CoV-2 che veniva trasmessa agli esseri umani attraverso i visoni e principalmente a quelli degli allevamenti nello Jutland Settentrionale. Il 5 novembre a seguito della rivelazione da parte della SSI di dodici infezioni umane causate dalla variante (otto direttamente associate ad allevamenti di visoni) e della potenziale riduzione dell'efficacia dei vaccini per la COVID-19,[35][36] la stessa prima ministra ha annunciato l'abbattimento dell'intera popolazione danese di visoni (circa 17 milioni di esemplari)[37][38] e l'inizio di misure di chiusura nazionale.[39]

Variante B.1.1.7/VOC-20DEC-01

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 VOC-202012/01.
Stati con casi confermati della variante VOC-202012/01 al 23 gennaio 2021

     100 - 999 casi confermati

     50 - 99 casi confermati

     10 - 49 casi confermati

     5 - 9 casi confermati

     2 - 4 casi confermati

     1 caso confermato

     Stato con casi confermati, ma di cui non si hanno cifre precise

     Casi sospetti

     Nessun caso o nessun dato

Rilevata per la prima volta nell'ottobre 2020 durante la pandemia di COVID-19 nel Regno Unito da un campione prelevato il mese precedente,[40] rispetto al virus che era stato isolato originariamente a Wuhan, la variante britannica contiene ben 17 differenze, cosa che la rende particolarmente differente dalle altre varianti, che di norma si differenziano dal ceppo originale cinese per 2-3 differenze totali.[41]

Micrografia elettronica a trasmissione di falsi colori della variante inglese. Si ritiene che la maggiore trasmissibilità della variante sia dovuta a cambiamenti nella struttura delle proteine spike, mostrate qui in verde.

Fra le principali differenze ci sono l'aumento delle segnalazioni di tosse dal 27% al 35% e l'elencazione di nuovi sintomi quali: affaticamento, dolori muscolari e mal di gola;[42][43] mentre a livello genetico si segnalano l’eliminazione di un particolare aminoacido in due punti del DNA e la sostituzione di un aminoacido nei confronti di un altro nelle zone N501Y, A570D, P681H, D614G, T716I, S982A, D1118H.[41]

È stimata essere del 30%-70%[44] più trasmissibile e letale del SARS-CoV-2 normale ed è legata a un aumento significativo delle infezioni da SARS-CoV-2 nel Paese.

VOC-202012/01

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 VOC-202102/02.

Rilevata per la prima volta il 4 marzo 2021 nello Stato dell'Oregon, è una variante del VOC-202012/01 nata spontaneamente e non importata,[45][46] che si distingue dall'originale versione inglese per un'ulteriore mutazione dell'E484K, dalla quale viene il nome B.1.1.7 con mutazioni E484K dato dal Public Health England.[47]

Variante B.1.1.207

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 lignaggio B.1.1.207.

Rilevata per la prima volta nel dicembre 2020 in Nigeria[48][49] e resa nota al pubblico dal direttore dell'African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases, John Nkengasong, che ha dichiarato che un ceppo di SARS-CoV-2 di cui si sono state trovate tracce, chiamata Variante B.1.1.207, era stata rintracciata nel Paese.[50]

La variante è stata sequenziata per la prima volta dallo stesso African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases, che ha trovato in essa una mutazione P681H, condivisa con la variante britannica e rappresenta circa l'1% dei genomi virali sequenziati durante la pandemia di COVID-19 in Nigeria,[49] con la possibilità di aumentare di pericolosità come dichiarato dal Centers for Disease Control and Prevention.[51]

Variante B.1.351/501.V2

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 501.V2.
Stati con casi confermati della variante 501.V2 al 29 gennaio 2021

     100 - 999 casi confermati

     50 - 99 casi confermati

     10 - 49 casi confermati

     5 - 9 casi confermati

     2 - 4 casi confermati

     1 caso confermato

     Stato con casi confermati, ma di cui non si hanno cifre precise

     Casi sospetti

     Nessun caso o nessun dato

Rilevata per la prima volta in Sudafrica, il 18 dicembre 2020, da medici del dipartimento sanitario sudafricano,[52] la variante, chiamata 501.V2,[53] è stata sequenziata da ricercatori e funzionari che hanno scoperto che la prevalenza della variante era più alta tra i giovani senza condizioni di salute sottostanti e che, rispetto ad altre varianti, provocava una malattia maggiormente grave.[54][55]

Mentre a livello biologico, gli scienziati hanno notato che la variante contiene diverse mutazioni che le consentono di legarsi più facilmente alle cellule umane a causa di tre mutazioni nel dominio di legame del recettore (RBD) nella glicoproteina spike del virus: N501Y,[56] K417N e E484.

Variante B.1.429/CAL.20C

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 lignaggio B.1.429.

Rilevata per la prima volta nel luglio 2020 da ricercatori del Cedars-Sinai Medical Center, in uno dei 1 230 campioni di virus raccolti nella contea di Los Angeles dall'inizio della pandemia di COVID-19,[57] la Variante B.1.429 o CAL.20C è definita da cinque mutazioni distinte (I4205V e D1183Y nel gene ORF1ab e S13I, W152C, L452R nel gene S delle proteine spike),[58] di cui il gene L452R (precedentemente anche rilevato in altri lignaggi non imparentati).[59][60] Considerato tra quelli più probabilmente trasmissibili, per un periodo non venne più rilevato fino a quando nel settembre 2020 è riapparso tra i campioni in California, ma con i numeri di casi molto bassi fino a novembre,[61] infatti nel novembre 2020 la variante rappresentava il 36% dei campioni raccolti presso il Cedars-Sinai Medical Center; mentre nel gennaio 2021 rappresentava il 50% dei campioni.[60] Successivamente tramite un comunicato stampa congiunto da parte di USCF, California Department of Public Health e Santa Clara County Public Health Department è stato annunciato la diffusione della variante in altri Stati degli Stati Uniti,[62] seguiti successivamente da alcuni casi in America del Nord, in Europa, in Asia e in Australia.

Variante B.1.526

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-COV-2 lignaggio B.1.526.

Rilevata per la prima volta nella città di New York,[63] la variante, che presenta la mutazione dello spike E484K, che può aiutare il virus a eludere gli anticorpi, e la mutazione dello spike S477N, che può aiutare il virus a legarsi più strettamente alle cellule umane, si è diffuso a febbraio 2021 nell'intero Stato di New York rappresentando un quarto della sequenza virale individuata nello Stato.[64] A partire dall'aprile seguente la variante ha iniziato la diffusione negli altri 49 Stati degli Stati Uniti d'America e in 18 Paesi stranieri.[65]

Variante B.1.617

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-COV-2 lignaggio B.1.617.
Stati con casi confermati della variante lignaggio B.1.617 al 21 aprile 2021.

     100+ casi confermati

     2 - 99 casi confermati

     1 caso confermato

     Nessun caso o nessun dato

Rilevata per la prima volta nell'ottobre 2020 in India, la variante B.1.617 o VUI-21APR-01 presenta 15 mutazioni genetiche, tra cui quelle delle proteine spike E484Q,[66] G142D,[67] D111D e L452R.[68] Dal primo rilevamento fino al gennaio 2021, ci sono stati pochi casi ma ad aprile si è iniziato a diffondere in almeno 20 Paesi in tutti i continenti.[69]

Variante P.1

Lo stesso argomento in dettaglio: SARS-CoV-2 lignaggio P.1.
Stati con casi confermati di lignaggio P.1 aggiornati all'11 febbraio 2021.[70]
Legenda:

     Trasmissione locale

     Trasmissione importata

     Metodo di trasmissione sconosciuta

Rilevata per la prima volta a Tokyo, il 6 gennaio 2021, dal National Institute of Infectious Diseases. Il nuovo ceppo, chiamato Variante P.1, è stato identificato in quattro persone arrivate a Tokyo con un aereo proveniente dallo Stato brasiliano di Amazonas il 2 gennaio.[71]

Presente in Brasile sin dal dicembre 2020, essa ha un totale di 17 mutazioni nel dominio di legame del recettore nella glicoproteina spike del virus: N501Y, E484K e K41YT, che causano:[72]

  • elevata capacità di infezione;
  • resistenza al plasma iperimmune;
  • inefficacia di alcuni anticorpi monoclonali.

Varianti sotto analisi

Variante B.1.1.317

Individuata per la prima volta nel marzo 2021 nel Queensland, in Australia, si hanno ufficialmente soltanto due casi noti: due persone di un albergo di Brisbane che hanno dovuto sottoporsi a una quarantena aggiuntiva di 5 giorni oltre ai 14 giorni obbligatori dopo che era stato confermato che erano stati infettati da questa variante.[73]

Variante B.1.1.318/VUI-21FEB-04

Individuata per la prima volta nel Regno Unito il 24 febbraio 2021, sono stati accertati solo 16 casi di persone affette dalla variante.[74]

Variante B.1.525/VUI-21FEB-03

Individuata per la prima volta nel Regno Unito e in Nigeria dal Public Healt England, la variante B.1.525 o VUI-21FEB-03 porta la stessa mutazione E484K trovata anche nelle varianti P.1 e P.2, porta anche la stessa delezione degli amminoacidi istidina (ΔH69) e valina (ΔV70) nelle posizioni 69 e 70 come nella variante inglese e le mutazione N439K e Y453F, quest'ultimo presente nella variante danese.[75] Al maggio 2021, questa variante è stata individuata in 23 Paesi, tra cui Regno Unito, Danimarca,[76] Finlandia, Norvegia,[77] Paesi Bassi,[78] Belgio, Francia, Spagna, Nigeria,[79] Ghana, Giordania, Giappone, Singapore, Australia, Canada, Germania, Italia,[80] Slovenia, Austria, Malesia, Svizzera, Irlanda[81][82] e Stati Uniti d'America.[83][84]

Variante B.1.618

Individuata per la prima volta nell'ottobre 2020 nel Bengala Occidentale, la variante B.1.618 ha una mutazione dello spike E484K.[85][86]

Variante P.3/VUI-21MAR-02

Individuata per la prima volta nel febbraio 2021 dal Kagawaran ng Kalusugan (Dipartimento della salute filippino) che ha confermato il rilevamento di una variante nel Visayas Centrale dopo che i campioni di alcuni pazienti sono stati inviati per il sequenziamento del genoma. Dai campioni sono state trovate le mutazioni delle proteine spike E484K e N501Y, rilevate in 37 campioni su 50, con entrambe le mutazioni co-presenti in 29 di questi.[87] Il 13 marzo, a seguito della conferma da parte del Dipartimento della Salute che le mutazioni costituivano una variante, ha preso il nome di variante P.3 e,[88] in seguito, data la diffusione in Asia[89] e in Europa[90][91] ha preso il nome di VUI-21MAR-02.

Differenza dell'efficacia dei vaccini

Lo stesso argomento in dettaglio: Vaccino anti COVID-19.
Video della World Health Organization che descrive come le varianti proliferano nelle aree non vaccinate

La potenziale comparsa di una variante SARS-CoV-2 moderatamente o completamente resistente alla risposta anticorpale provocata dall'attuale generazione di vaccini anti-COVID-19 potrebbe richiedere la modifica dei vaccini.[92] Le ricerche indicano che molti vaccini sviluppati per il ceppo iniziale hanno un'efficacia inferiore per alcune varianti rispetto alla sequenza iniziale.[93] A partire dal febbraio 2021, la Food and Drug Administration statunitense riteneva che tutti i vaccini autorizzati dalla stessa rimanessero efficaci nella protezione contro i ceppi circolanti di SARS-CoV-2.[92]

Variante B.1.1.7/VOC-20DEC-01

A metà dicembre 2020, nel Regno Unito è stata identificata la nuova variante del SARS-CoV-2 (VOC-202012/01). I dati preliminari hanno indicato che questa variante ha mostrato un aumento stimato del numero di riproduzione (R) di 0,4 o superiore e una maggiore trasmissibilità fino al 70%, ma senza prove di una minore efficacia del vaccino su di essa.[94]

Altri dati hanno affermato:

Variante B.1.351/501.V2

Successivamente alla diffusione della variante si è subito iniziato a progettare un vaccino capace di difendere il corpo pure da questa variante, e il primo tentativo è stato da parte dell'azienda statunitense Moderna.[98]

Il 29 gennaio 2021, l'azienda Johnson & Johnson, che aveva condotto prove per il suo vaccino Ad26.COV2.S in Sudafrica, ha riferito che il livello di protezione contro l'infezione da COVID-19 era del 72% negli Stati Uniti e del 57% in Sudafrica.[99] Qualche giorno dopo, il 6 febbraio 2021, il Financial Times ha riferito dei dati provvisori di uno studio condotto dall'Università del Witwatersrand congiuntamente con l'Università di Oxford che hanno dimostrato una ridotta efficacia del vaccino AstraZeneca,[100] sulla base di uno studio di 2 000 campioni.[101] Perciò, il giorno seguente, il ministro della salute sudafricano ha sospeso il previsto dispiegamento di circa un milione di dosi del vaccino in attesa di maggiori dati.[102][103]

Il 17 febbraio 2021, Pfizer ha dichiarato che l'attività di neutralizzazione del proprio vaccino era ridotta di due terzi per questa variante, affermando però che non potevano ancora essere fatte affermazioni sull'efficacia del vaccino nella prevenzione della malattia per questa variante e che bisognavano altri studi,[104][105][106] che successivamente hanno confermato la ridotta attività neutralizzante dei sieri di pazienti vaccinati con i vaccini Moderna e Pfizer-BioNTech.[107] Il mese seguente, altri studi hanno invece dichiarato che il vaccino era efficace al 100% (cioè che tra i vaccinati non si erano riscontrati casi d'infezione).[108]

Variante P.1/20J/501Y.V3

La variante sembra essere parzialmente inefficace al vaccino Pfizer-BioNTech.[109]

Variante B.1.617

Fra le quindici mutazioni che la caratterizzano, quelle in E484Q[110] e L452R[111] risultano essere potenzialmente contrarie alla formazione di anticorpi.[112]

Note

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Voci correlate

Collegamenti esterni

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