DNA nucleotidil-esotrasferasi

Da Wikipedia, l'enciclopedia libera.
DNA nucleotidil-esotrasferasi
(Trasferasi Terminale)
Modello tridimensionale dell'enzima
Aminoacidi 19-125 della DNA nucleotidil-esotrasferasi umana. Rendering del PDB basato su 2coe.
Numero EC 2.7.7.31
Classe Transferasi
Nome sistematico
TDT: Deossinucleotide Trasferasi Terminale
Altri nomi
Deossinucleotidil Trasferasi Terminale
Enzima di addizione terminale
Banche dati BRENDA, EXPASY, GTD, KEGG, PDB
Fonte: IUBMB

L'enzima nucleare DNA nucleotidil-esotrasferasi, noto comunemente come trasferasi terminale (in inglese: terminal deoxynucleotidyl transferase, sigla TDT, oppure anche come DNA nucleotidylexotransferase, DNTT), è una DNA polimerasi espressa in cellule linfoidi immature, pre-B, e nelle cellule della leucemia acuta linfoblastica e del linfoma.

La funzione della TdT è quella di aggiungere gli N-nucleotidi terminali agli esoni di variabilità, diversità e giunzione durante la antibody gene recombination. Negli esseri umani, la trasferasi terminale viene codificata dal geneDNTT.[1][2]

Funzione[modifica | modifica wikitesto]

La TdT catalizza l'aggiunta di nucleotidi all'estremità 3' terminale della molecola di DNA. A differenza della maggior parte delle polimerasi del DNA non richiede un template. Il substrato preferito da questo enzima è il 3'-overhang, ma è in grado di aggiungere nucleotidi alle estremità 3' tagliate o strappate. Necessita di cobalto come cofattore, comunque l'enzima riesce a catalizzare la reazione in vitro anche con la somministrazione di manganese e/o di magnesio.

Utilizzi[modifica | modifica wikitesto]

La trasferasi terminale ha applicazioni in biologia molecolare. Può essere impiegata nella procedura RACE per aggiungere nucleotidi che possono essere usati come un template per un primer nella procedura successiva di reazione a catena della polimerasi (PCR). Può essere anche usata per aggiungere nucleotidi marcati con isotopi radioattivi, ad esempio nel saggio biochimico noto come TUNEL assay (Terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP Nick End Labeling) per la dimostrazione dell'apoptosi (processo di morte cellulare programmata, che in parte è contraddistinto dal DNA frammentato).

La trasferasi terminale può essere usata anche nei test di immunofluorescenza per la diagnosi di leucemia acuta linfoblastica.[3]

Genetica[modifica | modifica wikitesto]

DNA nucleotidil-esotrasferasi (Homo sapiens)
Gene
Entrez 1791
Locus Chr. 10 q23-24
Proteina
UniProt P04053
PDB 2coe
Enzima
EC number 2.7.7.31

Il gene umano DNTT per la proteina TDT si trova nel cromosoma 10, braccio q23-q24, vicino ad altre chinasi come la esochinasi 1 che si trova nel chr.10 q-22.

Note[modifica | modifica wikitesto]

  1. ^ Isobe M, Huebner K, Erikson J, Peterson RC, Bollum FJ, Chang LM, Croce CM, Chromosome localization of the gene for human terminal deoxynucleotidyltransferase to region 10q23-q25 in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 82, nº 17, settembre 1985, pp. 5836–40, PMC 390648, PMID 3862101.
  2. ^ Yang-Feng TL, Landau NR, Baltimore D, Francke U, The terminal deoxynucleotidyltransferase gene is located on human chromosome 10 (10q23-q24) and on mouse chromosome 19 in Cytogenet. Cell Genet., vol. 43, 3-4, 1986, pp. 121–6, PMID 3467897.
  3. ^ Faber J, Kantarjian H, Roberts MW, Keating M, Freireich E, Albitar M, Terminal deoxynucleotidyl transferase-negative acute lymphoblastic leukemia in Arch. Pathol. Lab. Med., vol. 124, nº 1, gennaio 2000, pp. 92–7, PMID 10629138.

Bibliografia[modifica | modifica wikitesto]

  • O'Malley DP, Orazi A, Terminal deoxynucleotidyl transferase-positive cells in spleen, appendix and branchial cleft cysts in pediatric patients. in Haematologica, vol. 91, nº 8, 2006, pp. 1139-40, PMID 16885057.
  • Yamashita N, Shimazaki N, Ibe S, et al., Terminal deoxynucleotidyltransferase directly interacts with a novel nuclear protein that is homologous to p65. in Genes Cells, vol. 6, nº 7, 2001, pp. 641-52, PMID 11473582.
  • Chang LM, Bollum FJ, Molecular biology of terminal transferase. in CRC Crit. Rev. Biochem., vol. 21, nº 1, 1986, pp. 27-52, PMID 3524991.
  • Maezawa S, Hayano T, Koiwai K, et al., Bood POZ containing gene type 2 is a human counterpart of yeast Btb3p and promotes the degradation of terminal deoxynucleotidyltransferase. in Genes Cells, vol. 13, nº 5, 2008, pp. 439-57, DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01179.x, PMID 18429817.
  • Taplin ME, Frantz ME, Canning C, et al., Evidence against T-cell development in the adult human intestinal mucosa based upon lack of terminal deoxynucleotidyltransferase expression. in Immunology, vol. 87, nº 3, 1996, pp. 402-7, PMID 8778025.
  • Grupe A, Li Y, Rowland C, et al., A scan of chromosome 10 identifies a novel locus showing strong association with late-onset Alzheimer disease. in Am. J. Hum. Genet., vol. 78, nº 1, 2006, pp. 78-88, DOI:10.1086/498851, PMID 16385451.
  • Dworzak MN, Fritsch G, Fröschl G, et al., Four-color flow cytometric investigation of terminal deoxynucleotidyl transferase-positive lymphoid precursors in pediatric bone marrow: CD79a expression precedes CD19 in early B-cell ontogeny. in Blood, vol. 92, nº 9, 1998, pp. 3203-9, PMID 9787156.
  • Fujita K, Shimazaki N, Ohta Y, et al., Terminal deoxynucleotidyltransferase forms a ternary complex with a novel chromatin remodeling protein with 82 kDa and core histone. in Genes Cells, vol. 8, nº 6, 2003, pp. 559-71, PMID 12786946.
  • Kubota T, Maezawa S, Koiwai K, et al., Identification of functional domains in TdIF1 and its inhibitory mechanism for TdT activity. in Genes Cells, vol. 12, nº 8, 2007, pp. 941-59, DOI:10.1111/j.1365-2443.2007.01105.x, PMID 17663723.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al., Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library. in Gene, vol. 200, 1-2, 1997, pp. 149-56, PMID 9373149.
  • Bridges SL, Frequent N addition and clonal relatedness among immunoglobulin lambda light chains expressed in rheumatoid arthritis synovia and PBL, and the influence of V lambda gene segment utilization on CDR3 length. in Mol. Med., vol. 4, nº 8, 1998, pp. 525-53, PMID 9742508.
  • Liu L, McGavran L, Lovell MA, et al., Nonpositive terminal deoxynucleotidyl transferase in pediatric precursor B-lymphoblastic leukemia. in Am. J. Clin. Pathol., vol. 121, nº 6, 2004, pp. 810-5, DOI:10.1309/QD18-PPV1-NH3T-EUTF, PMID 15198352.
  • Yang B, Gathy KN, Coleman MS, Mutational analysis of residues in the nucleotide binding domain of human terminal deoxynucleotidyl transferase. in J. Biol. Chem., vol. 269, nº 16, 1994, pp. 11859-68, PMID 8163485.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al., The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). in Genome Res., vol. 14, 10B, 2004, pp. 2121-7, DOI:10.1101/gr.2596504, PMID 15489334.
  • Thai TH, Kearney JF, Distinct and opposite activities of human terminal deoxynucleotidyltransferase splice variants. in J. Immunol., vol. 173, nº 6, 2004, pp. 4009-19, PMID 15356150.
  • Shimazaki N, Fujita K, Koiwai O, [Expression and function of terminal deoxynucleotidyl-transferase and discovery of novel DNA polymerase mu] in Seikagaku, vol. 74, nº 3, 2002, pp. 227-32, PMID 11974916.
  • Mahajan KN, Mitchell BS, Role of human Pso4 in mammalian DNA repair and association with terminal deoxynucleotidyl transferase. in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 100, nº 19, 2003, pp. 10746-51, DOI:10.1073/pnas.1631060100, PMID 12960389.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al., Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 99, nº 26, 2002, pp. 16899-903, DOI:10.1073/pnas.242603899, PMID 12477932.
  • Mahajan KN, Gangi-Peterson L, Sorscher DH, et al., Association of terminal deoxynucleotidyl transferase with Ku. in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 96, nº 24, 1999, pp. 13926-31, PMID 10570175.
  • Ibe S, Fujita K, Toyomoto T, et al., Terminal deoxynucleotidyltransferase is negatively regulated by direct interaction with proliferating cell nuclear antigen. in Genes Cells, vol. 6, nº 9, 2001, pp. 815-24, PMID 11554927.

Voci correlate[modifica | modifica wikitesto]

Collegamenti esterni[modifica | modifica wikitesto]