Da Wikipedia, l'enciclopedia libera.
| aconitato idratasi |
Dettaglio del legame tra citrato (qui rappresentato da un analogo), cluster ferro-zolfo ed alcuni amminoacidi chiave dell'aconitasi |
| Numero EC |
4.2.1.3 |
| Classe |
Liasi |
| Nome sistematico |
| citrato(isocitrato) idro-liasi (formante cis-aconitato) |
| Altri nomi |
| cis-aconitasi; aconitasi; AcnB; 2-metilaconitato idratasi; citrato(isocitrato) idro-liasi |
| Banche dati |
BRENDA, EXPASY, GTD, KEGG, PDB |
| Fonte: IUBMB |
| Aconitasi 1 (solubile) |
 |
|
|
| Aconitasi 2 (mitocondriale) |
|
|
|
La aconitato idratasi (o aconitasi) è un enzima di localizzazione mitocondriale che catalizza la isomerizzazione del citrato ad isocitrato nel corso del ciclo di Krebs. Essa si svolge nei due seguenti passaggi:
- citrato = cis-aconitato + H2O
- cis-aconitato + H2O = isocitrato
In contrasto con la maggior parte delle proteine con cluster ferro-zolfo, che funzionano come trasportatori di elettroni, il cluster presente sulla aconitasi reagisce direttamente con il substrato[2]. L'enzima presente un cluster [Fe4S4]2+, che può essere inattivato alla forma [Fe3S4]+. Si è dimostrato che tre residui di cisteina sono ligandi del centro [Fe4S4]. Nello stato attivo, il Fe2+ non è coordinato dalle cisteine ma da molecole d'acqua.
[modifica] Analoghi della aconitasi
La 3-isopropilmalato deidratasi (o α-isopropilmalato isomerasi, numero EC 4.2.1.33), un enzima che catalizza il secondo passaggio della biosintesi della leucina, e la iron-responsive element binding protein (IRE-BP, dall'inglese proteina legante un elemento responsivo al ferro), sono analoghi dell'aconitasi. Gli IRE sono una famiglia di acidi nucleici da 28 nucleotidi, non codificanti, con una conformazione a gemma; essi regolano la sintesi dei gruppi eme, l'ingresso ed il deposito di ferro. Essi partecipano anche al legame con i ribosomi, nonché alla degradazione del mRNA.
La IRE-BP lega gli IRE sia all'estremità 3' che a quella 5', ma solo se è ancora come apoenzima, in assenza cioè del cluster ferro-zolfo. Si è studiata l'espressione della IRE-BP in cellule in coltura. Se la cellula è priva di ferro, la IRE-BP lavora come RNA-binding protein; se è presente ferro, essa lavora come semplice aconitasi[3]. IRE-BP mutate, prive di tutte le cisteine necessarie alla formazione del cluster, perdono del tutto l'attività di aconitasi, ma mantengono quella di RNA-bp[4]. Questo sembra confermare l'importanza del cluster ferro-zolfo nell'attività di aconitasi.
- ^ H. Lauble, C. D. Stout: Steric and conformational features of the aconitase mechanism. In: Proteins 22, S. 1-11, 1995
- ^ Flint, D.H. and Allen, R.M. (1996). Iron-sulfur proteins with nonredox functions. Chem. Rev. 96: 2315–2334.
- ^ Frishman, D. and Hentze, M.W. (1996). Conservation of aconitase residues revealed by multiple sequence analysis. Eur. J. Biochem. 239: 197–200.
- ^ Beinert, H., Kennedy, M.C. and Stout, C.D. (1996). Aconitase as iron-sulfur protein, enzyme, and iron-regulatory protein. Chem. Rev. 96: 2335–2373.
- (EN) Dickman, S.R. Aconitase. In: Boyer, P.D., Lardy, H. and Myrbäck, K (Eds), The Enzymes, 2nd edn, vol. 5, Academic Press, New York, 1961, pp. 495–510.
- (EN) Morrison, J.F. The purification of aconitase. Biochem. J. 56 (1954) 99–105. Entrez PubMed 13126098
- (EN) Lauble, H., Kennedy, M.C., Beinert, H. and Stout, C.D. Crystal structures of aconitase with trans-aconitate and nitrocitrate bound. J. Mol. Biol. 237 (1994) 437–451. Entrez PubMed 8151704
[modifica] Collegamenti esterni
