Genomica strutturale
La genomica strutturale si occupa della determinazione della struttura tridimensionale di tutte le proteine di un dato organismo, tramite metodi sperimentali come la cristallografia a raggi X, la spettroscopia NMR o approcci computazionali come l'homology modelling.
Contrariamente a quanto avviene nella biologia strutturale, la determinazione della struttura proteica attraverso la genomica strutturale avviene spesso (ma non sempre) prima di conoscere la funzione proteica. Questo solleva nuove sfide per la bioinformatica strutturale, come la determinazione della funzione di una proteina dalla sua struttura tridimensionale.
Mentre molti biologi strutturali si occupano della struttura di una singola proteina o di un gruppo di proteine, gli specialisti in genomica strutturale studiano le proteine di un intero genoma. Un vantaggio importante di questo approccio è il risparmio economico che si ottiene dalla clonazione, espressione e purificazione su vasta scala. D'altra parte però il valore scientifico di alcune strutture risultati è ancora dubbio.
Voci correlate[modifica | modifica wikitesto]
Altri progetti[modifica | modifica wikitesto]
Wikimedia Commons contiene immagini o altri file su Genomica strutturale
Collegamenti esterni[modifica | modifica wikitesto]
- (EN) Un articolo del gennaio 2006 che analizza il campo della genomica strutturale, su sciencemag.org.
- (EN) Structural Genomics Consortium, su sgc.utoronto.ca. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 21 ottobre 2008).
- (EN) Protein Structure Initiative, su nigms.nih.gov. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 6 ottobre 2008).
- (EN) Northeast Structural Genomics Consortium, su nesg.org.
- (EN) The Midwest Center for Structural Genomics, su mcsg.anl.gov. URL consultato il 14 aprile 2019 (archiviato dall'url originale il 28 marzo 2018).
- (EN) Berkeley Structural Genomics Center, su strgen.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 31 dicembre 2006).
- (EN) Center for Eukaryotic Structural Genomics, su uwstructuralgenomics.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 28 aprile 2007).
- (EN) Yeast Structural Genomics (Genomique Structurale de la levure), su genomics.eu.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 23 giugno 2001).
- (EN) RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, su rsgi.riken.go.jp. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 30 dicembre 2006).
- (EN) Structural Genomics of Pathogenic Protozoa, su sgpp.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 22 febbraio 2007).
- (EN) The Joint Center for Structural Genomics, su jcsg.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 23 ottobre 2008).
- (EN) New York Structural Genomics Research Consortium (NYSGRC), su nysgrc.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 20 ottobre 2008).
- (EN) NJCST Initiative in Structural Genomics and Bioinformatics, su www-nmr.cabm.rutgers.edu. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 5 luglio 2008).
- (EN) Structural Genomics at Brookhaven Natl. Labs, su proteome.bnl.gov. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 2 dicembre 2004).
- (EN) Structure to Function Pilot Project: CARB, su s2f.carb.nist.gov. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 30 novembre 2004).
- (EN) The Southeast Collaboratory for Structural Genomics, su secsg.org. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 26 novembre 2004).
- (EN) Toronto Structural Proteomics Consortium, su uhnres.utoronto.ca.
- (EN) Protein Structure Factory, su proteinstrukturfabrik.de. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 12 giugno 2007).
- (EN) Oxford Protein Production Facility, su oppf.ox.ac.uk. URL consultato il 22 dicembre 2006 (archiviato dall'url originale il 13 giugno 2004).
