Omeobox: differenze tra le versioni
(Nessuna differenza)
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Versione delle 22:18, 1 ott 2010
Una regione omeobox (dall'inglese: homeobox) è una sequenza del DNA che dirige i geni coinvolti nella regolazione delle procedure di sviluppo (morfogenetico) negli animali, funghi e piante.
Scoperta
Homeodomain
RRRKRTA-YTRYQLLE-LEKEFLF-NRYLTRRRRIELAHSL-NLTERHIKIWFQN-RRMK-WKKEN
Geni Hox
Diversità
Piante
Geni umani
Gli esseri umani generalmente contengono i geni Hox in quattro cluster genetici:
| nome | cromosoma | gene |
| HOXA (noto a volte come HOX1) - HOXA@ | cromosoma 7 | HOXA1, HOXA2, HOXA3, HOXA4, HOXA5, HOXA6, HOXA7, HOXA9, HOXA10, HOXA11, HOXA13 |
| HOXB - HOXB@ | cromosoma 17 | HOXB1, HOXB2, HOXB3, HOXB4, HOXB5, HOXB6, HOXB7, HOXB8, HOXB9, HOXB13 |
| HOXC - HOXC@ | cromosoma 12 | HOXC4, HOXC5, HOXC6, HOXC8, HOXC9, HOXC10, HOXC11, HOXC12, HOXC13 |
| HOXD - HOXD@ | cromosoma 2 | HOXD1, HOXD3, HOXD4, HOXD8, HOXD9, HOXD10, HOXD11, HOXD12, HOXD13 |
Esiste anche una famiglia di omeobox meno distale ("distal-less homeobox"): DLX1, DLX2, DLX3, DLX4, DLX, e DLX6.
"HESX homeobox 1" è noto anche come HESX1.
en:Short stature homeobox gene è noto anche come SHOX.
Proteine umane addizionali che contengono questo domain in base alla annotazione UniProt:
- ADNP; ALX3; ALX4; ARGFX; ARX
- BAPX1; BARHL1; BARHL2; BARX1; BARX2; CART1
- CDX1; CDX2; CDX4; CRX; CUTL1; CUTL2
- DBX1; DBX2; DLX1; DLX2; DLX3; DLX4; DLX5; DLX6; DMBX1; DPRX; DRGX; DUX1; DUX2; DUX3; DUX4; DUX4c; DUX5; DUXA
- EMX1; EMX2; EN1; EN2; ESX1L; EVX1; EVX2
- GBX1; GBX2; GSC; GSC2; GSX1; GSX2
- HDX; HESX1; HHEX; HLX1; HMBOX1; HMX1; HMX2; HMX3; HOMEZ; HOPX
- IRX1; IRX2; IRX3; IRX4; IRX5; IRX6; ISL1; ISL2; ISX
- LASS3; LASS5; LASS6; LBX1; LBX2; LHX1; LHX2; LHX3; LHX4; LHX5; LHX6; LHX8; LHX9; LMX1A; LMX1B; LOC340260
- MEIS1; MEIS2; MEIS3; MEOX1; MEOX2; MIXL1; MKX; MNX1; MSX1; MSX2
- NANOG; NANOGP1; NANOGP8; NKX2-2; NKX2-3; NKX2-4; NKX2-5; NKX2-8; NKX3-1; NKX6-1; NKX6-2; NKX6-3; NOBOX
- ONECUT1; ONECUT2; ONECUT3; OTP; OTX1; OTX2
- PAX3; PAX4; PAX6; PAX7; PAX7B; PBX1; PBX2; PBX3; PBX4; PDX1; PHOX2A; PHOX2B; PITX1; PITX2; PITX3; PKNOX1; PKNOX2; POU1F1; POU2F1; POU2F2; POU2F3; POU3F1; POU3F2; POU3F3; POU3F4; POU4F1; POU4F2; POU4F3; POU5F1; POU5F1P1; POU5F1P4; POU5F2; POU6F2; PROP1; PRRX1; PRRX2
- RAX; RAXL1; RHOXF1; RHOXF2
- SATB1; SATB2; SEBOX; SHOX; SHOX2; SIX1; SIX2; SIX3; SIX4; SIX5; SIX6
- TCF1; TCF2; TGIF1; TGIF2; TGIF2LX; TGIF2LY; TITF1; TLX1; TLX2; TLX3; TSHZ1; TSHZ2; TSHZ3
- VAX1; VAX2; VENTX; VSX1; VSX2
- ZFHX2; ZFHX3; ZFHX4; ZHX1
Mutazioni
Regolazione
La regolazione dei geni Hox è estremamente complessa e coinvolge reciproche interazioni, per la maggior parte inibitorie. La mosca Drosophila utilizza i complessi di proteine Polycomb e Trithorax per mantenere l'espressione dei geni Hox dopo la "down-regulation" della regola del paio e dei geni gap che avviene durante lo sviluppo larvale. Le proteine del gruppo Polycomb possono silenziare i geni HOX, grazie alla modulazione della struttura della cromatina. [1]
Voci correlate
Note
- ^ Portoso M and Cavalli G, The Role of RNAi and Noncoding RNAs in Polycomb Mediated Control of Gene Expression and Genomic Programming, in RNA and the Regulation of Gene Expression: A Hidden Layer of Complexity, Caister Academic Press, 2008, ISBN 978-1-904455-25-7.
Bibliografia
- Lodish et al., Molecular Cell Biology, 5th, New York, W.H. Freeman and Company, 2003, ISBN 0-7167-4366-3.
- Ogishima S, Tanaka H, Missing link in the evolution of Hox clusters, in Gene, vol. 387, n. 1-2, January 2007, pp. 21–30, DOI:10.1016/j.gene.2006.08.011.