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Testo tradotto da en: interatomic potentials

Il Potenziale interatomico è una definizione utilizzata per riferirsi ad un gruppo di funzioni matematiche usate per calcolare l'energia potenziale di un sistema di atomi con le posizioni note nello spazio.[1][2][3][4] Il potenziale interatomico è ampiamente usato come base fisica nelle simulazioni di meccanica molecolare e dinamica molecolare in chimica, fisica molecolare e fisica dei materiali, in connessione ad effetti come la coesione, la dilatazione termica e le proprietà elastiche dei materiali.[5][6][7][8][9][10]

Forma funzionale[modifica | modifica wikitesto]

Il potenziale interatomico può essere scritto come sviluppo in serie di funzioni che dipendono dalla posizione di uno,due,tre o più atomi in un determinato momento nel tempo. Quindi il potenziale totale di un sistema può essere scritto come: [3]

Dove è il potenziale del primo termine, il quello del secondo , quello del terzo, indica il numero di atomi nel sistema, la posizione i degli atomi, mentre i, j e k sono gli indici che ci danno la posizione degli atomi nello spazio.

Da notare il fatto che, nel caso in cui venga dato un paio di potenziali per paio di atomi, al secondo termine il potenziale deve essere moltiplicato per 1/2 (se così non fosse infatti il legame verrebbe contato 2 volte), e analogamente il terzo termine per 1/6..[3] In alternativa, la sommatoria di due termini può essere ricondotta al caso e analogamente per il terzo termine al caso , se la forma potenziale è tale che sia simmetrica rispetto al cambio degli indici (questo non si verifica nel caso di potenziali di sistemi a più elementi).

Il primo termine è significativo solo se gli atomi sono in un campo esterno (ad esempio un campo elettrico). In assenza di campi esterni il potenziale non dipende dalle posizioni assolute degli atomi, ma solo dalle posizioni relative. Questo significa che la forma funzionale può essere riscritta come una funzione di distanze interatomiche e angoli tra i legami (vettori vicini tra loro) .

Quindi,in assenza di forze esterne, la forma generale diventa:

nel terzo termine la distanza interatomica non è necessaria poichè i tre termini sono sufficienti per dare le posizioni relative dei tre atomi i,j,k nello spazio tridimensionale. Ogni termine di ordine più alto del secondo è chiamato potenziale a più termini. In alcuni potenziali interatomici le interazioni multicorpo sono integrate in termini a coppie di potenziali (leggi la discussione sui simil-EAM e il potenziale a ordine di legame più in basso).

Fondamentalmente le somme nelle espressioni si riferiscono a tutti gli N atomi. Tuttavia, se l'intervallo del potenziale interatomico è finito, per esempio il potenziale riferito ad una distanza limite , la sommatoria può essere ristretta agli atomi con la stessa distanza limite tra loro. Anche utilizzando un metodo cellulare per trovare gli atomi vicini,[1] gli algoritmi della dimamica molecolare possono essere algoritmi asintotici . I potenziali con un intervallo infinito possono essere riassunti nella sommatoria di Ewald e nei suoi sviluppi successivi.

Calcolo della forza[modifica | modifica wikitesto]

Le forze che agiscono tra gli atomi possono essere ottenute dalla differenziazione dell'energia totale rispetto alle posizioni degli atomi. Per questo, per definire la forza su un atomo è possibile prendere il gradiente rispetto alla la posizione dell'atomo :

Per il secondo termine del potenziale questo gradiente si riduce, grazie alla simmetria rispetto a nella forma potenziale, a semplici differenziazioni rispetto alla distanza interatomica .

Tuttavia, per i potenziali a più termini (tre termini, quattro termini, ecc.) la differenziazione diventa considerabilmente più complessa [11] [12] poichè il potenziale non può essere a lungo simmetrico rispetto al cambio di . In altre parole, l'energia degli atomi che non sono direttamente legati a può dipendere dalla posizione perchè termini angolari e altri termini successivi, contribuiscono al gradiente .

Classi di potenziali interatomici[modifica | modifica wikitesto]

Esistono molte varietà di potenziali interatomici, a causa di diverse motivazioni fisiche. Anche per un singolo elemento noto come il silicone, esistono molte varietà di potenziali piuttosto diversi nella loro forma funzionale per motivi che ora svilupperemo. [13] Le vere interazioni interatomiche in natura sono quanti di energia, e non ci sono ,per ora, strade conosciute per cui le vere interazioni descitte dall'equazione di Schrödinger o dall'equazione di Dirac per tutti gli elettroni e nuclei possano essere inserite in una forma analitica funzionale. The true interatomic interactions are quantum mechanical in nature, and there is no known way in which the true interactions described by the Schrödinger equation or Dirac equation for all electrons and nuclei could be cast into an analytical functional form. Hence all analytical interatomic potentials are by necessity approximations.

Pair potentials[modifica | modifica wikitesto]

The arguably simplest widely used interatomic interaction model is the Lennard-Jones potential [14]

where is the depth of the potential well and is the distance at which the potential crosses zero. The term proportional to in the potential can be motivated from a classical or quantum mechanical description of the interaction between induced electric dipoles.[6] This potential seems to be quite accurate for noble gases, and is widely used for systems where dipole interactions are significant, including in chemistry force fields to describe intermolecular interactions.

Another simple and widely used pair potential is the Morse potential, which consists simply of a sum of two exponentials.

Here is the equilibrium bond energy and the bond distance. The Morse potential has been applied to studies of molecular vibrations and solids ,[15] and although rarely used anymore, inspired the functional form of more modern potentials such as the bond-order potentials.

Ionic materials are often described by a sum of a short-range repulsive term, such as the Buckingham pair potential, and a long-range Coulomb potential giving the ionic interactions between the ions forming the material. The short-range term for ionic materials can also be of many-body character .[16]

Pair potentials have some inherent limitations, like the inability to describe all 3 elastic constants of cubic metals.[7] Hence modern molecular dynamics simulations are to a large extent carried out with different kinds of many-body potentials.

Many-body potentials[modifica | modifica wikitesto]

The Stilinger-Weber potential[17] is a potential that has a two-body and three-body terms of the standard form

where the three-body term describes how the potential energy changes with bond bending. It was originally developed for pure Si, but has been extended to many other elements and compounds [18] [19] and also formed the basis for other Si potentials.[20] [21]

Metals are very commonly described with what can be called "EAM-like" potentials, i.e. potentials that share the same functional form as the embedded atom model. In these potentials, the total potential energy is written

where is a so-called embedding function (not to be confused with the force ) that is a function of the sum of the so-called electron density . is a pair potential that usually is purely repulsive. In the original formulation [22] the electron density function was obtained from true atomic electron densities, and the embedding function was motivated from density-functional theory as the energy needed to 'embed' an atom into the electron density. .[23] However, many other potentials used for metals share the same functional form but motivate the terms differently, e.g. based on tight-binding theory [24] [25] or other motivations [26] [27] .[28]

EAM-like potentials are usually implemented as numerical tables. A collection of tables is available at the interatomic potential repository at NIST [1]

Covalently bonded materials are often described by bond order potentials, sometimes also called Tersoff-like or Brenner-like potentials. [10] [29] [30]

These have in general a form that resembles a pair potential:

where the repulsive and attractive part are simple exponential functions similar to those in the Morse potential. However, the strength is modified by the environment of the atom via the term. If implemented without an explicit angular dependence, these potentials can be shown to be mathematically equivalent to some varieties of EAM-like potentials [31] [32] Thanks to this equivalence, the bond-order potential formalism has been implemented also for many metal-covalent mixed materials.[32][33] [34] [35]

Repulsive potentials for short-range interactions[modifica | modifica wikitesto]

For very short interatomic separations, important in radiation material science, the interactions can be described quite accurately with screened Coulomb potentials which have the general form

here φ(r) → 1 when r → 0. Here and are the charges of the interacting nuclei, and a is the so-called screening parameter. A widely used popular screening function is the "Universal ZBL" one.[36] and more accurate ones can be obtained from all-electron quantum chemistry calculations [37] In binary collision approximation simulations this kind of potential can be used to describe the nuclear stopping power.

Potential fitting[modifica | modifica wikitesto]

Since the interatomic potentials are approximations, they by necessity all involve parameters that need to be adjusted to some reference values. In simple potentials such as the Lennard-Jones and Morse ones, the parameters can be set directly to match e.g. the equilibrium bond length and bond strength of a dimer molecule or the cohesive energy of a solid .[6] However, many-body potentials often contain tens or even hundreds of adjustable parameters. These can be fit into a larger set of experimental data, or materials properties derived from more fundamental simulation models such as density-functional theory. For solids, a well-constructed many-body potential can often describe at least the equilibrium crystal structure cohesion and lattice constant, linear elastic constants, and basic point defect properties of all the elements and stable compounds well. [21][32][34][35] [38] [39] .[40] The aim of most potential construction and fitting is to make the potential transferable, i.e. that it can describe materials properties that are clearly different from those it was fitted to (for examples of potentials explicitly aiming for this, see e.g.[41][42]). As an example of demonstrated partial transferability, a review of interatomic potentials of Si found that for instance the Stillinger-Weber and Tersoff III potentials for Si are indeed able to describe several (but certainly not all) materials properties they were not fitted to .[13]

The NIST interatomic potential repository provides a collection of fitted interatomic potentials, either as fitted parameter values or numerical tables of the potential functions.[43]

Reliability of interatomic potentials[modifica | modifica wikitesto]

Classical interatomic potentials cannot reproduce all phenomena. Sometimes quantum description is necessary. Density functional theory is used to overcome this limitation.

See also[modifica | modifica wikitesto]

References[modifica | modifica wikitesto]

  1. ^ a b M. P. Allen and D. J. Tildesley. Computer Simulation of Liquids. Oxford University Press, Oxford, England, 1989.
  2. ^ Daan Frenkel and Berend Smit. Understanding molecular simulation: from algorithms to applications. Academic Press, San Diego, second edition, 2002.
  3. ^ a b c R. Lesar. Introduction to Computational Materials Science. Cambridge University Press, 2013.
  4. ^ D. W. Brenner. The art and science of an analytical potential. Physica Status Solidi B, 217:23, 2000
  5. ^ N. W. Ashcroft and N. D. Mermin. Solid State Physics.Saunders College, Philadelphia, 1976.
  6. ^ a b c Charles Kittel. Introduction to Solid State Physics. John Wiley & Sons, New York, third edition, 1968.
  7. ^ a b Murray S. Daw, Stephen M. Foiles, and Micael I. Baskes. The embedded-atom method: a review of theory and applications, Mat. Sci. Rep., 9:251, 1993.
  8. ^ J. Tersoff. New Empirical approach for the structure and energy of covalent systems. Phys. Rev. B, 37:6991, 1988
  9. ^ M. W. Finnis, Bond-order potentials through the ages,Progress in Materials Science 52 (2007) 133
  10. ^ a b Sinnott, S.B., Brenner, D.W. (2012) Three decades of many-body potentials in materials research. MRS Bulletin 37: 469-473
  11. ^ K. M. Beardmore and N. Gr/onbech-Jensen. Direct simulation of ion beam induced stressing and amorphization of silicon. Phys. Rev. B, 60:12610, 1999.
  12. ^ K. Albe, J. Nord, and K. Nordlund. Dynamic charge-transfer bond-order potential for gallium nitride. Phil. Mag. A, 89:3477--3497, 2009.
  13. ^ a b H. Balamane, T. Halicioglu, and W. A. Tiller. Comparative study of silicon empirical interatomic potentials. Phys. Rev. B, 46(4):2250, 1992.
  14. ^ J. E. Lennard-Jones, On the Determination of Molecular Fields, in Proc. R. Soc. Lond. A, vol. 106, n. 738, 1924, pp. 463–477, DOI:10.1098/rspa.1924.0082..
  15. ^ L. A. Girifalco and V. G. Weizer. Application of the Morse potential function to cubic metals. Phys. Rev., 114(3):687, 1959.
  16. ^ B. P. Feuston and S. H. Garofalini. Empirical three-body potential for vitreous silica. J. Chem. Phys., 89(9):5818, 1988.
  17. ^ F. H. Stillinger and T. A. Weber. Computer simulation of local order in condensed phases of silicon. Phys. Rev. B, 31:5262, 1985
  18. ^ M. Ichimura. Stillinger-weber potentials for iii-v compound semiconductors and their application to the critical thickness calculation for inas/gaas. Physica Status Solidi A, 153(2):431--7, 1996.
  19. ^ H. Ohta and S. Hamaguchi. Classical interatomic potentials for si-o-f and si-o-cl systems. J. Chemical Physics, 115(14):6679--90, 2001.
  20. ^ Environment-dependent interatomic potential for bulk silicon, in Phys. Rev. B, vol. 56, n. 14, 1997, DOI:10.1103/PhysRevB.56.8542.
  21. ^ a b J. F. Justo, M. Z. Bazant, E. Kaxiras, V. V. Bulatov, and S. Yip. Interatomic potential for silicon defects and disordered phases. Phys. Rev. B, 58:2539, 1998.
  22. ^ S. M. Foiles, M. I. Baskes, and M. S. Daw. Embedded-atom-method functions for the fcc metals cu, ag, au, ni, pd, pt, and their alloys. Phys. Rev. B, 33(12):7983, 1986. Erratum: ibid, Phys. Rev. B 37, 10378 (1988).
  23. ^ M. J. Puska, R. M. Nieminen, and M. Manninen. Atoms embedded in an electron gas: Immersion energies. Phys. Rev. B, 24(6):3037, 1981.
  24. ^ M. W. Finnis and J. E. Sinclair. A simple empirical n-body potential for transition metals. Phil. Mag. A, 50(1):45, 1984. see also Erratum, ibid. 53 (1986) 161.
  25. ^ F. Cleri and V. Rosato. Tight-binding potentials for transition metals and alloys. Phys. Rev. B, 48(1):22, 1993.
  26. ^ C. L. Kelchner, D. M. Halstead, L. S. Perkins, N. M. Wallace, and A. E. DePristo. Construction and evaluation of embedding functions. Surf. Sci., 310:425--435, 1994. and references therein.
  27. ^ S. L. Dudarev and P. M. Derlet. A magnetic interatomic potential for molecular dynamics simulations. J. Phys.: Condens. Matter, 17:1--22, 2005.
  28. ^ P. Olsson, J. Wallenius, C. Domain, K. Nordlund, and L. Malerba. Two-band modeling of alpha-prime phase formation in Fe-Cr. Phys. Rev. B, 72:214119, 2005.
  29. ^ New empirical approach for the structure and energy of covalent systems, in Physical Review B, vol. 37, n. 12, 1988, pp. 6991–7000, DOI:10.1103/PhysRevB.37.6991.
  30. ^ Empirical potential for hydrocarbons for use in simulating the chemical vapor deposition of diamond films, in Physical Review B, vol. 42, n. 15, 1990, pp. 9458–9471, DOI:10.1103/PhysRevB.42.9458.
  31. ^ Relationship between the embedded-atom method and Tersoff potentials, in Physical Review Letters, vol. 63, n. 9, 1989, p. 1022, DOI:10.1103/PhysRevLett.63.1022.
  32. ^ a b c Modeling the metal-semiconductor interaction: Analytical bond-order potential for platinum-carbon, in Physical Review B, vol. 65, n. 19, 2002, p. 195124, DOI:10.1103/PhysRevB.65.195124.
  33. ^ Structural properties of amorphous silicon nitride, in Phys. Rev. B, vol. 58, n. 13, 1998, DOI:10.1103/PhysRevB.58.8323.
  34. ^ a b N. Juslin, P. Erhart, P. Träskelin, J. Nord, K. O. E. Henriksson, K. Nordlund, E. Salonen, and K. Albe. Analytical interatomic potential for modelling non-equilibrium processes in the w-c-h system. J. Appl. Phys., 98:123520, 2005.
  35. ^ a b Paul Erhart, Niklas Juslin, Oliver Goy, Kai Nordlund, Ralf Muller, and Karsten Albe. Analytic bond-order potential for atomistic simulations of zinc oxide. J. Phys.: Condens. Matter, 18:6585--6605, 2006.
  36. ^ J. F. Ziegler, J. P. Biersack, and U. Littmark. The Stopping and Range of Ions in Matter. Pergamon, New York, 1985.
  37. ^ K. Nordlund, N. Runeberg, and D. Sundholm. Repulsive interatomic potentials calculated using hartree-fock and density-functional theory methods. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B, 132:45--54, 1997.
  38. ^ Furio Ercolessi and J. B. Adams. Interatomic potentials from first-principles calculations: the force-matching method. Europhys. Lett., 26:583, 1994.
  39. ^ Y. Mishin, M. J. Mehl, and D. A. Papaconstantpoulos. Embedded-atom potential for b2-NiAl. Phys. Rev. B, 65:224114, 2002.
  40. ^ Keith Beardmore and Roger Smith. Empirical potentials for c-si-h systems with application to c60 interactions with si crystal surfaces. Phil. Mag. A, 74:1439--1466, 1996.
  41. ^ Varghese Swamy and Julian D. Gale, Transferable variable-charge interatomic potential for atomistic simulation of titanium oxides, Phys. Rev. B 62 (2000) 5406
  42. ^ Andrés Aguado, Leonardo Bernasconi, Paul A. Madden, A transferable interatomic potential for MgO from ab initio molecular dynamics, Chem. Phys. Lett. 356 (2002) 437
  43. ^ U.S. Department of Commerce, National Institute of Standards and Technology, Interatomic Potentials Repository Project, su ctcms.nist.gov.

External links[modifica | modifica wikitesto]