Entrez

L'Entrez Global Query Cross-Database Search System è un sistema di ricerca integrato tra banche dati biomediche contenenti informazioni di tipo differente.

Entrez è coordinato dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) statunitense, parte della National Library of Medicine (NLM) (essa stessa parte dei National Institutes of Health (NIH)).

Tipi di ricerca

Entrez è un potente motore di ricerca che permette una ricerca contemporanea su differenti database biomedici.

PubMed. Raccoglie i riferimenti agli articoli apparsi su un numero elevato di riviste scientifiche, principalmente di tipo biomedico. Contiene anche riferimenti immediati ad articoli scientifici ad accesso libero.
PubMed Central. Raccoglie articoli scientifici ad accesso libero.
Bookshelf. Raccoglie libri di testo di argomenti biomedici ad accesso libero.
OMIM. Cataloga tutte le patologie umane aventi una componente genetica.
OMIA. Cataloga tutte le patologie animali aventi una componente genetica.
Nucleotide. Banca dati di sequenza nucleotidica (GenBank).
Protein. Banca dati di sequenza proteica.
Genome. Raccoglie sequenze genomiche complete.
Structure. Contiene strutture tridimensionali di macromolecole.
Taxonomy. Cataloga gli organismi secondo la classificazione scientifica.
SNP. Raccoglie gli SNPs (single nucleotide polymorphisms).
Gene. Raccoglie informazioni di sequenza centrate sui singoli geni.
HomoloGene. Classifica i geni a seconda dell'omologia tra differenti specie.
PubChem Compound. Raccoglie informazioni sulle strutture chimiche di piccole molecole chimiche.
PubChem Substance. Raccoglie dati depositati su molecole chimiche.
Genome Project. Informazioni sui progetti genoma in corso.
CDD. Contiene un database con i domini conservati delle proteine.
3D Domains. Contiene domini provenienti da Entrez Structure.
UniSTS. Raccoglie dati di marcatura e mappatura.
PopSet. Cataloga dati relativi a studi sulla popolazione (epidemiologia).
Cancer Chromosomes: database citogenetici
PubChem BioAssay: vaglio dell'attività biologica di sostanze chimiche
GENSAT: atlante dell'espressione genica nel sistema nervoso del topo
Probe: sequenza specifica di reagenti

Il sistema Entrez può mostrare visuali delle sequenze di geni e proteine e mappe cromosomiche. Entrez può efficientemente richiamare le sequenze, strutture e le referenze relative. Alcuni libri di testo sono anche disponibili online grazie al sistema Entrez. Entrez Global Query è un motore di ricerca integrato che fornisce accesso a tutti i database contemporaneamente.