Entrez

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Logo di Entrez

L'Entrez Global Query Cross-Database Search System è un sistema di ricerca integrato tra banche dati biomediche contenenti informazioni di tipo differente.

Entrez è coordinato dal National Center for Biotechnology Information (NCBI) statunitense, parte della National Library of Medicine (NLM) (essa stessa parte dei National Institutes of Health (NIH)).

Tipi di ricerca[modifica | modifica sorgente]

Entrez è un potente motore di ricerca che permette una ricerca contemporanea su differenti database biomedici.

  • PubMed. Raccoglie i riferimenti agli articoli apparsi su un numero elevato di riviste scientifiche, principalmente di tipo biomedico. Contiene anche riferimenti immediati ad articoli scientifici ad accesso libero.
  • PubMed Central. Raccoglie articoli scientifici ad accesso libero.
  • Bookshelf. Raccoglie libri di testo di argomenti biomedici ad accesso libero.
  • OMIM. Cataloga tutte le patologie umane aventi una componente genetica.
  • OMIA. Cataloga tutte le patologie animali aventi una componente genetica.
  • Nucleotide. Banca dati di sequenza nucleotidica (GenBank).
  • Protein. Banca dati di sequenza proteica.
  • Genome. Raccoglie sequenze genomiche complete.
  • Structure. Contiene strutture tridimensionali di macromolecole.
  • Taxonomy. Cataloga gli organismi secondo la classificazione scientifica.
  • SNP. Raccoglie gli SNPs (single nucleotide polymorphisms).
  • Gene. Raccoglie informazioni di sequenza centrate sui singoli geni.
  • HomoloGene. Classifica i geni a seconda dell'omologia tra differenti specie.
  • PubChem Compound. Raccoglie informazioni sulle strutture chimiche di piccole molecole chimiche.
  • PubChem Substance. Raccoglie dati depositati su molecole chimiche.
  • Genome Project. Informazioni sui progetti genoma in corso.
  • CDD. Contiene un database con i domini conservati delle proteine.
  • 3D Domains. Contiene domini provenienti da Entrez Structure.
  • UniSTS. Raccoglie dati di marcatura e mappatura.
  • PopSet. Cataloga dati relativi a studi sulla popolazione (epidemiologia).
  • Cancer Chromosomes: database citogenetici
  • PubChem BioAssay: vaglio dell'attività biologica di sostanze chimiche
  • GENSAT: atlante dell'espressione genica nel sistema nervoso del topo
  • Probe: sequenza specifica di reagenti

Il sistema Entrez può mostrare visuali delle sequenze di geni e proteine e mappe cromosomiche. Entrez può efficientemente richiamare le sequenze, strutture e le referenze relative. Alcuni libri di testo sono anche disponibili online grazie al sistema Entrez. Entrez Global Query è un motore di ricerca integrato che fornisce accesso a tutti i database contemporaneamente.

Collegamenti esterni[modifica | modifica sorgente]