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ATUM è un'azienda di biotecnologia americana che fornisce strumenti e soluzioni per le scienze della vita, dalla progettazione e sintesi di DNA ottimizzato alla produzione di proteine e allo sviluppo di linee cellulari GMP.

Storia

ATUM (precedentemente DNA2.0 ) è stata fondata nel 2003 a Menlo Park, in California.

L'azienda è una società privata [1] e continua ad avere tutte le attività di ricerca, sviluppo e produzione in California, attualmente nella sua struttura di Newark. [2]

Ha iniziato e continua ad essere un fornitore di sintesi genica e ingegneria proteica per il mondo accademico, il governo e le industrie farmaceutiche, chimiche, agricole e biotecnologiche. La sintesi genica ha rapidamente sostituito la clonazione molecolare per molti laboratori accademici e aziendali, in quanto "fonderie per l'era delle biotecnologie" che consentono geni su ordinazione per la ricerca biologica. [3]

DNA2.0 è stato presentato nella mostra PBS Nova ScienceNow [4] per mostrare come i geni vengono creati sinteticamente in un laboratorio. Nel 2008, l'azienda ha fornito alcuni degli allungamenti di DNA utilizzati per creare un genoma batterico sintetico. [5]

Strumenti di ricerca

  • Gene Designer è un pacchetto software bioinformatico gratuito. [6] [7] Viene utilizzato dai biologi molecolari per progettare, [8] clonare e convalidare sequenze genetiche. [9]
  • Uno strumento di progettazione gRNA gratuito con algoritmi di punteggio per CRISPR .
  • DNA ATLAS è uno strumento gratuito di mappatura plasmidica per mostrare caratteristiche come promotori, marcatori, siti di restrizione e frame di lettura aperti in qualsiasi sequenza di vettori di DNA.
  • Il toolbox online di Bioinformatica è stato selezionato come Best of the Web da Genetic Engineering News. [10]

Note

  1. ^ Mary Duan, Gene synthesis: It’s no strain for DNA 2.0, in Silicon Valley Business Journal, San Jose, CA, October 18, 2009.
  2. ^ MercuryNews.com, http://markets.financialcontent.com/mng-ba.mercurynews/news/read/31760923/DNA2.0_Builds_State_of_the_Art_Bioproduction_Facility_in_Newark.
  3. ^ Pollack, How Do You Like Your Genes? Biofabs Take Orders, in The New York Times, New York, September 12, 2007.
  4. ^ https://www.youtube.com/watch?v=nBmxkZEKCi0.
  5. ^ Pollack, Scientists Take New Step Toward Man-Made Life, in The New York Times, New York, January 24, 2008.
  6. ^ Alan Villalobos, Jon E Ness e Claes Gustafsson, Gene Designer: A synthetic biology tool for constructing artificial DNA segments, in BMC Bioinformatics, vol. 7, 2006, pp. 285, DOI:10.1186/1471-2105-7-285, PMID 16756672.
  7. ^ Alan Villalobos, Mark Welch e Jeremy Minshull, In Silico Design of Functional DNA Constructs, in Gene Synthesis, Methods in Molecular Biology, vol. 852, 2012, pp. 197–213, DOI:10.1007/978-1-61779-564-0_15, ISBN 978-1-61779-563-3, PMID 22328435.
  8. ^ M Welch, A Villalobos e C Gustafsson, Designing genes for successful protein expression, in Methods in Enzymology, vol. 498, 2011, pp. 43–66, DOI:10.1016/B978-0-12-385120-8.00003-6, PMID 21601673.
  9. ^ Amber Dance, Mover Over, Mother Nature., in The Scientist, July 1, 2012.
  10. ^ Best of the Web, in Genetic Engineering News, April 15, 2007.