Geneticina
| Geneticina | |
|---|---|
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| Nome IUPAC | |
| (2R,3S,4R,5R,6S)-5-amino-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,5-diidrossi-5-metil-4-metilaminoossan-2-ossi-2-idrossicicloesil]ossi-
2-(1-idrossietil)ossan-3,4-diolo | |
| Nomi alternativi | |
| Geneticina O-2-amino-2,7-didesossi-D-glicero-α-D-gluco-eptopiranosil-(1→4)-O-(3-desossi-4-C-metil-3-(metilamino)-β-L-arabinopiranosil- (1→6))-D-streptamina | |
| Caratteristiche generali | |
| Formula bruta o molecolare | C20H40N4O10 |
| Massa molecolare (u) | 496.55 g/mol |
| Numero CAS | |
| PubChem | 123865 |
| DrugBank | DBDB04263 |
| SMILES | CC(C1C(C(C(C(O1)OC2C(CC(C(C2O)OC3C(C(C(CO3)(C)O)NC)O)N)N)N)O)O)O |
| Proprietà chimico-fisiche | |
| Solubilità in acqua | 50 mg/mL |
| Indicazioni di sicurezza | |
La geneticina (G418) è un antibiotico aminoglicosidico che presenta una struttura simile alla gentamicina B1. Il composto è sintetizzato da Micromonospora rhodorangea.[1] Il G418 lega la subunità 80S del ribosoma bloccando la fase di allungamento della sintesi proteica, in cellule sia procariote sia eucariote.
Uso in biologia cellulare
[modifica | modifica wikitesto]La resistenza al G418 è conferita dal gene neo (Tn5 aph2) che codifica per un enzima con attività aminoglicoside 3'-fosfotrasferasica (APT), comunemente inserito in plasmidi per espressione genica per consentire la selezione di linee cellulari trasfettate stabilmente.[2][3] Molti plasmidi di espressione disponibili in commercio contengono neo come marcatore selezionabile. APT è in grado di fosforilare i gruppi ossidrilici della geneticina sopprimendo l'effetto della sostanza.[4] In generale per batteri e alghe sono utilizzate concentrazioni di 5 mg/l o inferiori, mentre per le cellule di mammifero sono utilizzate concentrazioni di circa 400 mg/l per la selezione e 200 mg/l per il mantenimento. Tuttavia, la concentrazione ottimale per la selezione di cloni resistenti dipende dalla linea cellulare utilizzata nonché dal plasmide che porta il gene di resistenza, è pertanto necessario definire una curva dose-mortalità per determinare la migliore condizione per ogni sistema sperimentale.
Note
[modifica | modifica wikitesto]- ^ G.H. Wagman, et al., Antibiotic G-418, a new Micromonospora-produced aminoglycoside with activity against protozoa and helminths: fermentation, isolation, and preliminary characterization, in Antimicrob. Agents Chemother, vol. 6, n. 2, 1974, pp. 144–149, PMID 15828184.
- ^ S. Grimm, The art and design of genetic screens: mammalian culture cells, in Nature Rev Gen, vol. 5, n. 3, 2004, pp. 179-189.
- ^ F. Wurm, Production of recombinant protein therapeutics in cultivated mammalian cells, in Nature Biotechnol, vol. 22, n. 11, 2004, pp. 1393-1398.
- ^ C. Hadfield, et al., G418-resistance as a dominant marker and reporter for gene expression in Saccharomyces cerevisiae, in Curr. Genet., vol. 18, n. 4, 1990, pp. 303–313, PMID 2174744.
