Dopo aver iniziato a giocare nel Colombes, squadra della sua città natale, nel 2011 Marie-Antoinette Katoto si trasferì al Paris Saint-Germain. Nel 2015 fece il suo esordio in Division 1 nelle ultime due giornate di campionato e alla prima partita realizzò la sua prima rete in massima serie. Nello stesso anno esordì in UEFA Champions League negli ultimi minuti della semifinale di ritorno vinta contro il Wolfsburg[1]. Nella stagione 2015-2016 si alternò tra la prima squadra e la squadra Under-19, mentre dalla stagione 2016-2017 è entrata appieno a far parte della prima squadra. Al termine del campionato 2017-2018, concluso con 21 reti realizzante in 21 presenze, migliore marcatrice del Paris Saint-Germain, ha vinto il premio UNFP come migliore giovane del torneo[2].