Nella stagione 2003-2004 il neopromosso Pavia disputa il girone A del campionato di Serie C1, ma tutto gira per il verso storto per la squadra pavese. Rispetto al torneo precedente dove ha vinto alla grande il campionato, percorre il cammino inverso, dall'altare alla polvere nella serie superiore, pagando il salto di categoria. A torneo finito, in piena estate, dopo l'amara conclusione con l'ultimo posto a 32 punti e la conseguente retrocessione in Serie C2, giunge la lieta notizia, che gli azzurri potranno disputare il prossimo campionato, di nuovo in Serie C1 perché riammessi. La squadra di Marco Torresani è partita in campionato con il piede sbagliato, viene sconfitta in casa (0-1) con la Lucchese, assapora la prima vittoria (2-0) al Lumezzane, all'ottava giornata. Chiude con 18 punti il girone di andata, in quint'ultima posizione, poi perde la bussola, nel girone di ritorno fa peggio di tutti, con solo 14 punti raccolti, si arriva così all'ultimo posto. Un po' meglio il percorso del Pavia nella Coppa Italia di Serie C, dove gli azzurri hanno vinto il girone C di qualificazione, superando Cremonese, Montichiari, Pizzighettone e Pro sesto, poi nei sedicesimi ha superato nel doppio confronto la Pro Vercelli, mentre viene poi eliminata negli ottavi dalla Pro Patria. Con 9 reti il brasiliano Inacio Joelson è risultato il miglior marcatore stagionale del Pavia, mentre Omar Nordi, dopo le abbuffate da grande bomber delle scorse stagioni, si ferma a 5 reti.
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