Nella stagione 1998-1999 il Carpi ha disputato il girone A del campionato di Serie C1, piazzandosi all'ultimo posto in classifica con 20 punti e retrocedendo in Serie C2 con Saronno e Padova. Il torneo è stato vinto con 66 punti dall'Alzano Virescit che è stato promosso in Serie B, accompagnato tra i cadetti dalla Pistoiese che ha vinto i playoff. A Carpi inizia il tracollo, i migliori sono ceduti, Walter De Vecchi rinuncia alla panchina, allora si punta su Luigi Sacchetti mediano del Verona tricolore. Dopo un illusorio successo d'apertura (1-0) all'Arezzo, inizia un vero calvario, dopo sei sconfitte di fila, salta la panchina del tecnico, arriva Gianni Balugani, che le prova tutte, compresi tanti ragazzi della Beretti, ma deve rassegnarsi, la marcia del Carpi non cambia. Al termine del torneo si contano 24 sconfitte, condite da 5 vittorie e 5 pareggi. Il tracollo dei carpigiani inizia così, ed avrà conseguenze peggiori nelle prossime stagioni. Nella Coppa Italia di Serie C il Carpi disputa il girone D di qualificazione, vinto dal Modena.
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