PAFAH1B1

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Fattore attivante la subunità alfa della idrolasi IB nelle piastrine
Gene
HUGOPAFAH1B1 LIS1
Entrez5048
LocusChr. 17 p13.3
Proteina
OMIM601545

L'enzima PAFAH1B1 (acronimo dall'inglese: Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha, che significa fattore attivante la subunità alfa della idrolasi IB nelle piastrine) è una proteina enzimatica, attiva anche nelle piastrine del sangue, che nell'essere umano viene codificata dal gene PAFAH1B1 (o LIS1).[1][2][3]

Il tratto genetico LIS1 (PAFAH1B1) è stato identificato come codificante per un gene che quando va incontro a mutazione o delezione provoca la malattia del cervello denominata lissencefalia, associata alla Sindrome di Miller-Dieker. PAFAH1B1 codifica per la sub-unità alfa non-catalitica della isoforma intracellulare Ib del fattore di attivazione delle piastrine acetil-idrolasi, un enzima etero-trimerico che catalizza specificamente la rimozione del gruppo acetilico nella posizione SN-2 del fattore di attivazione delle piastrine (identificato come 1-O-alchil-2-acetil-sn-gliceril-3-fosforilcolina). Esistono altre due isoforme di acetil-idrolasi intracellulare del fattore di attivazione delle piastrine: uno è composto di molteplici subunità, le altre, una singola sub-unità. In aggiunta, una isoforma di questo enzima a singola subunità si trova nel siero.[3]

Secondo uno studio, il fattore attivante PAFAH1B1 interagisce con il recettore di membrana VLDLR che viene attivato dalla relina (glicoproteina codificata dal cromosoma 7). [4]

Genomica[modifica | modifica wikitesto]

Il gene PAFAH1B1 (LIS1) si trova nel cromosoma 17p13.3 nella catena (plus) di Watson. Il gene ha una lunghezza di 91.953 basi e codifica per una proteina di 410 aminoacidi (con un peso molecolare predetto di 46.638 kiloDalton).

Interazioni[modifica | modifica wikitesto]

Si è dimostrato che PAFAH1B1 interagisce con la proteina DYNC1H1,[5] CLIP1,[6] NDEL1,[7][8] PAFAH1B3,[9] PAFAH1B2,[9] NUDC,[10] TUBA1A[11] e con la Doublecortina.[12]

Note[modifica | modifica wikitesto]

  1. ^ Reiner O, Carrozzo R, Shen Y, Wehnert M, Faustinella F, Dobyns WB, Caskey CT, Ledbetter DH, Isolation of a Miller-Dieker lissencephaly gene containing G protein beta-subunit-like repeats, in Nature, vol. 364, n. 6439, settembre 1993, pp. 717–21, DOI:10.1038/364717a0, PMID 8355785.
  2. ^ Lo Nigro C, Chong CS, Smith AC, Dobyns WB, Carrozzo R, Ledbetter DH, Point mutations and an intragenic deletion in LIS1, the lissencephaly causative gene in isolated lissencephaly sequence and Miller-Dieker syndrome, in Hum Mol Genet, vol. 6, n. 2, agosto 1997, pp. 157–64, DOI:10.1093/hmg/6.2.157, PMID 9063735.
  3. ^ a b Entrez Gene: PAFAH1B1 platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, alpha subunit 45kDa, su ncbi.nlm.nih.gov.
  4. ^ Zhang G, Assadi AH, McNeil RS, Beffert U, Wynshaw-Boris A, Herz J, Clark GD, D’Arcangelo G., The Pafah1b complex interacts with the Reelin receptor VLDLR, in PLoS ONE, vol. 2, n. 2, 2007, pp. e252, DOI:10.1371/journal.pone.0000252, PMC 1800349, PMID 17330141.
  5. ^ Chin-Yin Tai, Dujardin Denis L, Faulkner Nicole E, Vallee Richard B, Role of dynein, dynactin, and CLIP-170 interactions in LIS1 kinetochore function, in J. Cell Biol., vol. 156, n. 6, United States, marzo 2002, pp. 959–68, DOI:10.1083/jcb.200109046, ISSN 0021-9525 (WC · ACNP), PMC 2173479, PMID 11889140.
  6. ^ Frédéric M Coquelle, Caspi Michal, Cordelières Fabrice P, Dompierre Jim P, Dujardin Denis L, Koifman Cynthia, Martin Patrick, Hoogenraad Casper C, Akhmanova Anna, Galjart Niels, De Mey Jan R, Reiner Orly, LIS1, CLIP-170's key to the dynein/dynactin pathway, in Mol. Cell. Biol., vol. 22, n. 9, United States, maggio. 2002, pp. 3089–102, DOI:10.1128/MCB.22.9.3089-3102.2002, ISSN 0270-7306 (WC · ACNP), PMC 133759, PMID 11940666.
  7. ^ Kazuhito Toyo-oka, Shionoya Aki, Gambello Michael J, Cardoso Carlos, Leventer Richard, Ward Heather L, Ayala Ramses, Tsai Li-Huei, Dobyns William, Ledbetter David, Hirotsune Shinji, Wynshaw-Boris Anthony, 14-3-3epsilon is important for neuronal migration by binding to NUDEL: a molecular explanation for Miller-Dieker syndrome, in Nat. Genet., vol. 34, n. 3, United States, luglio 2003, pp. 274–85, DOI:10.1038/ng1169, ISSN 1061-4036 (WC · ACNP), PMID 12796778.
  8. ^ M Niethammer, Smith D S, Ayala R, Peng J, Ko J, Lee M S, Morabito M, Tsai L H, NUDEL is a novel Cdk5 substrate that associates with LIS1 and cytoplasmic dynein, in Neuron, vol. 28, n. 3, United States, dicembre 2000, pp. 697–711, DOI:10.1016/S0896-6273(00)00147-1, ISSN 0896-6273 (WC · ACNP), PMID 11163260.
  9. ^ a b K J Sweeney, Clark G D, Prokscha A, Dobyns W B, Eichele G, Lissencephaly associated mutations suggest a requirement for the PAFAH1B heterotrimeric complex in brain development, in Mech. Dev., vol. 92, n. 2, IRELAND, aprile 2000, pp. 263–71, ISSN 0925-4773 (WC · ACNP), PMID 10727864.
  10. ^ S M Morris, Albrecht U, Reiner O, Eichele G, Yu-Lee L Y, The lissencephaly gene product Lis1, a protein involved in neuronal migration, interacts with a nuclear movement protein, NudC, in Curr. Biol., vol. 8, n. 10, ENGLAND, maggio. 1998, pp. 603–6, DOI:10.1016/S0960-9822(98)70232-5, ISSN 0960-9822 (WC · ACNP), PMID 9601647.
  11. ^ T Sapir, Elbaum M, Reiner O, Reduction of microtubule catastrophe events by LIS1, platelet-activating factor acetylhydrolase subunit, in EMBO J., vol. 16, n. 23, ENGLAND, dicembre 1997, pp. 6977–84, DOI:10.1093/emboj/16.23.6977, ISSN 0261-4189 (WC · ACNP), PMC 1170301, PMID 9384577.
  12. ^ M Caspi, Atlas R, Kantor A, Sapir T, Reiner O, Interaction between LIS1 and doublecortin, two lissencephaly gene products, in Hum. Mol. Genet., vol. 9, n. 15, ENGLAND, settembre 2000, pp. 2205–13, ISSN 0964-6906 (WC · ACNP), PMID 11001923.

Bibliografia[modifica | modifica wikitesto]

Voci correlate[modifica | modifica wikitesto]

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Collegamenti esterni[modifica | modifica wikitesto]